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usoado木虫 (小有名气)
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[求助]
一个GAUSSIAN简单问题，但我太鹾求助
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log文件的内容 1/38=1/1; 2/12=2,17=6,18=5,40=1/2; 3/6=3,11=1,16=1,25=14,30=1,116=1/1,2,3,11,14; 4//1; 5/5=1/2; 6/7=2,8=2,9=2,10=2,28=1/1; 99/5=1,9=1,10=8/99; Error converting string" 6.5" to an integer. Out-of-memory error in routine RdGeom-1 (IEnd= 6750021 MxCore= 0) Use %mem=7MW to provide the minimum amount of memory required to complete this step. Error termination via Lnk1e in /home/dgh/g09/l101.exe at Tue Nov 15 10:50:04 2011. Job cpu time: 0 days 0 hours 0 minutes 0.1 seconds. File lengths (MBytes): RWF= 5 Int= 0 D2E= 0 Chk= 1 Scr= 1 lz刚学习GAUSSIAN软件，并按照教程装了LINUX 64的版本G09，然后想运行一下test里面的test000,出现了这个错误：Segmentation fault。上面的log文件是输出文件，大家帮忙看看，我在.bashrc里面加了 export GAUSS_MEMDEF=800MW 其他的和网上的安装教程一样。这里lz电脑4核8线程，8G内存。另外硬盘/home下的容量大概只有150G左右吧。大家看看，这该怎么解决? 谢谢。 |
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usoado
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usoado
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%mem=500MW ------------------------------------------------------ # SP, RHF/STO-3G punch=archive trakio scf=conventional ------------------------------------------------------ 1/38=1/1; 2/12=2,17=6,18=5,40=1/2; 3/6=3,11=1,16=1,25=14,30=1,116=1/1,2,3,11,14; 4//1; 5/5=1/2; 6/7=2,8=2,9=2,10=2,28=1/1; 99/5=1,9=1,10=8/99; ----------------------------------------- Gaussian Test Job 00 Water with archiving ----------------------------------------- Symbolic Z-matrix: Charge = 0 Multiplicity = 1 O H 1 0.96 H 1 0.96 2 109.47122 1 tetrahedral angles replaced. 1 tetrahedral angles replaced. Input orientation: --------------------------------------------------------------------- Center Atomic Atomic Coordinates (Angstroms) Number Number Type X Y Z --------------------------------------------------------------------- 1 8 0 0.000000 0.000000 0.000000 2 1 0 0.000000 0.000000 0.960000 3 1 0 0.905097 0.000000 -0.320000 --------------------------------------------------------------------- Distance matrix (angstroms): 1 2 3 1 O 0.000000 2 H 0.960000 0.000000 3 H 0.960000 1.567673 0.000000 Stoichiometry H2O Framework group C2V[C2(O),SGV(H2)] Deg. of freedom 2 Full point group C2V NOp 4 Largest Abelian subgroup C2V NOp 4 Largest concise Abelian subgroup C2 NOp 2 Standard orientation: --------------------------------------------------------------------- Center Atomic Atomic Coordinates (Angstroms) Number Number Type X Y Z --------------------------------------------------------------------- 1 8 0 0.000000 0.000000 0.110851 2 1 0 0.000000 0.783837 -0.443405 3 1 0 0.000000 -0.783837 -0.443405 --------------------------------------------------------------------- Rotational constants (GHZ): 919.0227225 408.0852053 282.5991530 Standard basis: STO-3G (5D, 7F) There are 4 symmetry adapted basis functions of A1 symmetry. There are 0 symmetry adapted basis functions of A2 symmetry. There are 1 symmetry adapted basis functions of B1 symmetry. There are 2 symmetry adapted basis functions of B2 symmetry. Integral buffers will be 131072 words long. Raffenetti 1 integral format. Two-electron integral symmetry is turned on. 7 basis functions, 21 primitive gaussians, 7 cartesian basis functions 5 alpha electrons 5 beta electrons nuclear repulsion energy 9.1571759100 Hartrees. NAtoms= 3 NActive= 3 NUniq= 2 SFac= 1.69D+00 NAtFMM= 80 NAOKFM=F Big=F One-electron integrals computed using PRISM. NBasis= 7 RedAO= T NBF= 4 0 1 2 NBsUse= 7 1.00D-06 NBFU= 4 0 1 2 对了log变成这样了。 |
4楼2011-11-15 15:13:35
usoado
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