24小时热门版块排行榜    

查看: 4517  |  回复: 12
本帖产生 1 个 BioEPI ,点击这里进行查看

zhoujg88

木虫 (正式写手)

[求助] 求助蛋白质分子三维尺寸

各位大侠,我遇到一些生物方面的问题:我想知道一些蛋白质的分子尺寸和其三维立体图,就是那种*nm×*nm×*nm的形式,可是不知道该怎么查,如溶菌酶(鸡蛋白)、胰蛋白酶、糜蛋白酶、牛血清白蛋白等物质,谁能帮帮我?谢谢!!!
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

nach

铜虫 (著名写手)

不让吃就去死

【答案】应助回帖

★ ★ ★
amisking(金币+3, BioEPI+1): 鼓励积极应助! 2011-11-13 19:07:27
zhoujg88(金币+5): 十分感谢!!这个尺寸是要自己量出来的吗?是不是应该有个固定值的呢? 2011-11-14 18:21:53
比方说胰蛋白酶,打开文件后你就可以看到3d结构,然后你可以任意测量蛋白分子





不让吃就去死
5楼2011-11-13 18:37:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lazywawa

铁杆木虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by nach at 2011-11-13 18:19:32
http://www.pdb.org/pdb/home/home.do
这个上基本都有, 都是pdb文件
然后下一个pymol,就可以看pdb文件,蛋白3d结构就可以看到了

这个不错,马克一下~~~
11楼2015-10-26 12:42:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

zhoujg88

木虫 (正式写手)

大侠们帮帮忙啊!!!!
2楼2011-11-13 14:40:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhoujg88

木虫 (正式写手)

求助啊!求助!!!!!
3楼2011-11-13 15:54:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

nach

铜虫 (著名写手)

不让吃就去死

【答案】应助回帖

★ ★
amisking(金币+2): 鼓励发帖交流! 2011-11-13 19:07:14
zhoujg88(金币+3): 谢谢! 2011-11-14 18:22:43
http://www.pdb.org/pdb/home/home.do
这个上基本都有, 都是pdb文件
然后下一个pymol,就可以看pdb文件,蛋白3d结构就可以看到了
不让吃就去死
4楼2011-11-13 18:19:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

affable

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

zhoujg88(金币+5): 谢谢!不过这些太专业了,我不是学生物的…… 2011-11-15 12:54:56
pdb bank包括所有已经解出单晶结构的蛋白质信息,包括形态,大小等等……但是pdb文件打开的程序有很多,众说纷纭,不知道哪个好,rastop用着还行,有人说molegro virtual docker非常强大,但是需要电脑硬件较好。
6楼2011-11-14 14:22:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhaoyuting

新虫 (小有名气)

吃得苦中苦,方为人上人!
7楼2011-11-29 09:52:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

月月大可

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
我用pymol,测量观察都很轻松。1.0版本一下都是免费的。
8楼2011-12-19 20:24:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhuduanxu

金虫 (正式写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by nach at 2011-11-13 18:37:26
比方说胰蛋白酶,打开文件后你就可以看到3d结构,然后你可以任意测量蛋白分子

你好,怎么用pymol测量精确测量有pdb数据的蛋白质的尺寸啊,谢谢大侠
9楼2015-02-03 09:17:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yinjuanchen

铁杆木虫 (著名写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by nach at 2011-11-13 18:37:26
比方说胰蛋白酶,打开文件后你就可以看到3d结构,然后你可以任意测量蛋白分子

本人菜鸟,刚接触pymol,请教一下这个距离的单位是不是埃?谢谢!
闭关,写写写
10楼2015-04-02 22:12:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 zhoujg88 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 YLHlRHNwYkce 2026-09-02 8/400 2026-09-03 12:05 by T0rGB46095mJ
[教师之家] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 YLHlRHNwYkce 2026-09-02 8/400 2026-09-03 12:03 by T0rGB46095mJ
[基金申请] 国社科又开始会评了,不知道这次命运如何 +9 雨打竹帘 2026-08-30 13/650 2026-09-03 08:16 by kudofaye
[基金申请] 麻烦专家们看看评委们的意见(F口面上) +8 gdd2018 2026-08-28 13/650 2026-09-03 06:22 by 羽毛枫f
[公派出国] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 ero8OE6tv9cu 2026-09-02 4/200 2026-09-03 03:14 by rM1TE0WVDIIY
[博后之家] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 ero8OE6tv9cu 2026-09-02 6/300 2026-09-02 23:59 by rM1TE0WVDIIY
[基金申请] 科研人应该花精力去思考如何解决问题,而不是去凝练问题 +7 瞬息宇宙 2026-09-01 14/700 2026-09-02 17:33 by ma0526
[基金申请] 要骂人了,新模版改版就是要淡化问题凝练这种虚的东西,结果有个评委还在说凝练得不够 +9 瞬息宇宙 2026-08-31 17/850 2026-09-02 14:04 by anjeeshine
[基金申请] 基金系统什么内容也没有 30+4 winsaint 2026-08-27 10/500 2026-09-02 11:35 by 大不刘6
[基金申请] 学科评审组评审是指会评吗? +5 瞬息宇宙 2026-08-31 5/250 2026-09-02 10:13 by 雨冰共舞
[基金申请] 面上函评意见出来了,像什么等级? 20+4 Tsingking1 2026-08-27 17/850 2026-09-01 19:51 by 超级无敌华子
[论文投稿] 小白求助 投论文要求的highlights应该如何写 5+3 l1963982152 2026-08-29 4/200 2026-09-01 09:04 by 北京莱茵编辑
[基金申请] 面上意见出来了 +12 黄鸟于飞Chao 2026-08-29 23/1150 2026-08-31 18:57 by 黄鸟于飞Chao
[基金申请] 能否申诉? +7 echo8914667 2026-08-30 8/400 2026-08-31 17:00 by yihongxu
[基金申请] 中青基了要发朋友圈吗? +7 349506619 2026-08-28 7/350 2026-08-31 13:39 by 冼亮淀粉酶
[基金申请] 29号明天会评吗 +4 笨笨唐 2026-08-28 4/200 2026-08-31 09:30 by huixian257
[基金申请] 为什么到现在没收到通知? +5 tannykie 2026-08-29 5/250 2026-08-30 21:05 by purplejack
[考博] 找导师 +6 yuanjiabao 2026-08-29 7/350 2026-08-30 14:40 by 生科新手
[基金申请] 我就是申请一个面上项目而已,这评审意见是按照杰青的条件评的吧? +6 gouxfjh 2026-08-28 11/550 2026-08-30 07:57 by gouxfjh
[基金申请] 国自然评审意见 +13 wangmingqi 2026-08-28 19/950 2026-08-29 10:22 by Poppy1104
信息提示
请填处理意见