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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 综合其他 » 求助蛋白质分子三维尺寸
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本帖产生 1 个 BioEPI ，点击这里进行查看

zhoujg88

木虫 (正式写手)

[求助] 求助蛋白质分子三维尺寸

各位大侠，我遇到一些生物方面的问题：我想知道一些蛋白质的分子尺寸和其三维立体图，就是那种*nm×*nm×*nm的形式，可是不知道该怎么查，如溶菌酶（鸡蛋白）、胰蛋白酶、糜蛋白酶、牛血清白蛋白等物质，谁能帮帮我？谢谢！！！
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1楼 2011-11-13 12:12:54
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

nach

铜虫 (著名写手)

不让吃就去死

【答案】应助回帖

★ ★ ★
amisking(金币+3, BioEPI+1): 鼓励积极应助！ 2011-11-13 19:07:27
zhoujg88(金币+5): 十分感谢！！这个尺寸是要自己量出来的吗？是不是应该有个固定值的呢？ 2011-11-14 18:21:53
比方说胰蛋白酶，打开文件后你就可以看到3d结构，然后你可以任意测量蛋白分子
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不让吃就去死
5楼2011-11-13 18:37:26
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lazywawa

铁杆木虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by nach at 2011-11-13 18:19:32
http://www.pdb.org/pdb/home/home.do
这个上基本都有， 都是pdb文件
然后下一个pymol，就可以看pdb文件，蛋白3d结构就可以看到了

这个不错，马克一下~~~
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11楼2015-10-26 12:42:39
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普通回帖

zhoujg88

木虫 (正式写手)
大侠们帮帮忙啊！！！！
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2楼2011-11-13 14:40:47
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zhoujg88

木虫 (正式写手)
求助啊！求助！！！！！
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3楼2011-11-13 15:54:05
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nach

铜虫 (著名写手)

不让吃就去死

【答案】应助回帖

★ ★
amisking(金币+2): 鼓励发帖交流！ 2011-11-13 19:07:14
zhoujg88(金币+3): 谢谢！ 2011-11-14 18:22:43
http://www.pdb.org/pdb/home/home.do
这个上基本都有， 都是pdb文件
然后下一个pymol，就可以看pdb文件，蛋白3d结构就可以看到了
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不让吃就去死
4楼2011-11-13 18:19:32
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affable

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

zhoujg88(金币+5): 谢谢！不过这些太专业了，我不是学生物的…… 2011-11-15 12:54:56
pdb bank包括所有已经解出单晶结构的蛋白质信息，包括形态，大小等等……但是pdb文件打开的程序有很多，众说纷纭，不知道哪个好，rastop用着还行，有人说molegro virtual docker非常强大，但是需要电脑硬件较好。
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6楼2011-11-14 14:22:00
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zhaoyuting

新虫 (小有名气)
????
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吃得苦中苦，方为人上人！
7楼2011-11-29 09:52:58
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月月大可

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
我用pymol，测量观察都很轻松。1.0版本一下都是免费的。
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8楼2011-12-19 20:24:47
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zhuduanxu

金虫 (正式写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by nach at 2011-11-13 18:37:26
比方说胰蛋白酶，打开文件后你就可以看到3d结构，然后你可以任意测量蛋白分子

你好，怎么用pymol测量精确测量有pdb数据的蛋白质的尺寸啊，谢谢大侠
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9楼2015-02-03 09:17:32
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yinjuanchen

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by nach at 2011-11-13 18:37:26
比方说胰蛋白酶，打开文件后你就可以看到3d结构，然后你可以任意测量蛋白分子

本人菜鸟，刚接触pymol,请教一下这个距离的单位是不是埃？谢谢！
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闭关，写写写
10楼2015-04-02 22:12:09
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