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voleyes

银虫 (正式写手)

[求助] 做表面模拟时为什么要加真空层(vacuum slab) ?

加上有什么意义,仅仅是为了在里面添加其他的分子吗?
加上以后在C方向也就有了周期性,如果我在表面上添加小分子后,那它跟顶上那层(考虑周期性也就是最下面那层)的作用怎么办?是不是要添加一个截断啊?
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voleyes

银虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by bingmou at 2011-11-05 06:26:57:
如果不加,那不就是晶体了吗?
为了防止这种相互作用,真空层必须足够大,所以需要测试

我都加到20埃了,用Discover做动力学模拟的时候,一部分小分子还是跑到上面去了,是不是还需要什么设置啊?
5楼2011-11-05 16:19:29
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voleyes

银虫 (正式写手)

引用回帖:
6楼: Originally posted by fzx2008 at 2011-11-05 16:22:55:
此为周期性的缘故
看似跑到上面去了,实际上是往下排斥了
你底层没有固定?

不是,下面有表面原子,固定了的,而小分子原来在表面上,后来就跑到上面去了
7楼2011-11-05 23:59:48
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