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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 如何去掉由MS搭建晶胞中的一个原子
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chengliping

铜虫 (小有名气)

[求助] 如何去掉由MS搭建晶胞中的一个原子

如何去掉由MS搭建晶胞中的一个原子？采用delete方法总是同时去掉了相应的同坐标原子，make p1也是这样，该怎么办？快帮帮我吧！
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1楼 2011-11-03 11:06:42
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

chengliping

铜虫 (小有名气)
是在build-symmetry-non periodic superstructure去掉周期性吗？这样做后可以删除一个原子但格子棱线消失了，周期性要从哪加上啊？
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7楼2011-11-07 17:49:02
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普通回帖

444239852

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
zzy870720z(金币+1): 鼓励交流 2011-11-03 20:25:53
你先选择一个原子然后在编辑里有有一个delete就可以那
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2楼2011-11-03 14:00:19
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qujinfeng

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
uuv2010(金币+1): 欢迎参加交流 2011-11-03 20:54:55
那样也会把等效的原子全部去掉，这个问题我也在期待中……
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3楼2011-11-03 14:36:04
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wzbhit

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★
uuv2010(金币+1): 欢迎参加交流 2011-11-03 20:55:07
这个问题也遇到过，由于对称性原因，总是一起删掉。make p1貌似不管用
同样期待中……
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从明天开始坚持吃早饭呀！
4楼2011-11-03 16:33:59
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acridine

木虫 (正式写手)
★
zzy870720z(金币+1): 谢谢解释 2011-11-03 20:26:55
make p1也不能删除平移对称性的，比如简单立方的8个顶点位置，只要周期性还在，它们就是等效的，不可能妄图只删除其中一个。不知道你说的是否是这种情况
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5楼2011-11-03 17:00:56
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lwg020810

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
uuv2010(金币+1): 多谢提示 2011-11-03 20:55:21
chengliping(金币+2): 是在build-symmetry-non periodic superstructure去掉周期性吗？这样做后可以删除一个原子但格子棱线消失了，周期性要从哪加上啊？ 2011-11-07 17:47:21
你试试先去掉周期性，把结构移动下，再删原子，再加周期性
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6楼2011-11-03 20:53:40
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chengliping

铜虫 (小有名气)
目前我只知道把晶胞搭建成超晶胞，然后有选择的删除一个原子（这个原子此时在超晶胞内部而不是棱上）
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8楼2011-11-07 17:53:11
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chengliping

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by acridine at 2011-11-03 17:00:56:
make p1也不能删除平移对称性的，比如简单立方的8个顶点位置，只要周期性还在，它们就是等效的，不可能妄图只删除其中一个。不知道你说的是否是这种情况

是这种情况，那么就是没有方法了？
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9楼2011-11-07 17:56:03
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franch

版主 (著名写手)
引用回帖:
9楼: Originally posted by chengliping at 2011-11-07 17:56:03:
是这种情况，那么就是没有方法了？

楼主再仔细想想，，，    你到底想建个什么？ 缺一个角的立方体？

你的问题出在建模思路上，晶胞是周期性的，所以，四个角都消失了是必然的
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chengliping
遇弱则弱
10楼2011-11-07 19:41:48
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