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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » 建模的挖孔问题
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jin9090900

铜虫 (小有名气)

[交流] 建模的挖孔问题 已有4人参与

最近读了一篇文献，在母体骨架上挖孔，然后进行吸附或化学反应的模拟。如图所示
大家一起讨论讨论，如何在晶体上挖出一个规整的孔呢？

我想的方法是，1. Edit-Atom Selection-选择径向，然后删掉。但是，选中的不是筒状，而是以某一圆心的球状，然后我就改变好几次坐标，近似抠出一个圆筒。
2. 导出cif文件，根据a,b坐标，删去落在孔内的原子，但是很费时间，很累。

大家都是怎么处理的呢？
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1楼 2011-11-02 11:36:48
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yuzhiboban

新虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
楼主那篇文献能分享一下吗？或者您发我邮箱也可以！感激不尽呢～840570945@qq.com

发自小木虫IOS客户端
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7楼2017-04-12 19:20:59
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zyj8119

木虫 (著名写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
zh1987hs(金币+1): 谢谢 2011-11-05 23:37:05
引用回帖:
1楼: Originally posted by jin9090900 at 2011-11-02 11:36:48:
最近读了一篇文献，在母体骨架上挖孔，然后进行吸附或化学反应的模拟。如图所示
大家一起讨论讨论，如何在晶体上挖出一个规整的孔呢？

我想的方法是，1. Edit-Atom Selection-选择径向，然后删掉。但是，选中 ...

monte carlo板块有个我发的挖孔的帖子，你可以看看。
赞一下(2人) 回复此楼
好好学习，天天向上。
2楼2011-11-05 12:41:34
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rjrj1107

新虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
请问哈2楼的你发的那个帖子我怎么找不到呢。能否给个链接
赞一下(1人) 回复此楼
3楼2011-11-07 19:33:45
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rjrj1107

新虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
一楼的你好，能否给我发哈你找到了那篇挖孔的文章，比较感兴趣，想看看
赞一下(1人) 回复此楼
4楼2011-11-07 19:45:00
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