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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » material studio DPD模块 模拟结果的RDF分析
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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lixiang_0807

金虫 (正式写手)

[求助] material studio DPD模块 模拟结果的RDF分析

material studio 的DPD模块模拟的结果可以用radial distribution function（RDF, 也叫pair correlation function）来分析吗？

我看MS的help文件里说只有amorphous，discover和Forcite才可以做RDF分析，但是好多文献里DPD模拟的都有RDF分析

求助大家，先谢谢了
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@zyj8119

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1楼 2011-11-01 22:43:11
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tianlangxingaa

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
12楼: Originally posted by jolly1987 at 2011-11-05 10:38:41:
MesoDyn是基于平均场密度泛函理论的计算方法,它的基本思想是非均相态体系的自由能F 是区域密度函数Q的函数。DPD是粗粒化模型，每一个粒子相应于多个原子组成的基团，珠子之间用弹簧简谐振子连接，体系的运动行为 ...

Totally agree with you.

Cheers
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16楼2011-11-11 19:03:47
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tianlangxingaa

铁杆木虫 (著名写手)
★ ★
ghcacj(金币+2): 谢谢 2011-11-03 09:39:17
You can write your own code to calculate RDF based on the coordinates from MS.
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2楼2011-11-02 16:37:43
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lixiang_0807

金虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by tianlangxingaa at 2011-11-02 16:37:43:
You can write your own code to calculate RDF based on the coordinates from MS.

非常感谢！！
你的意思是MS的DPD模块不能直接分析RDF，是吗？
如果是的话，我还想问一个问题。在DPD完成后，有一个.Dpd_out文件，它里边并不包含坐标信息，是不是这些要从.mtd文件里边获取呢？

再次感谢！！
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3楼2011-11-02 19:54:49
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jolly1987

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by tianlangxingaa at 2011-11-02 16:37:43:
You can write your own code to calculate RDF based on the coordinates from MS.

Very interesting! Could you tell us how to write the code? Thank you!
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4楼2011-11-03 09:31:12
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