应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » 请问如何自动生成化学键
81/1返回列表
查看: 2327  |  回复: 7
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

jin9090900

铜虫 (小有名气)

[求助] 请问如何自动生成化学键

现在我是这么做的Al 和O 两种原子按照配比随机放在晶胞里，做一步几何优化，使最稳定。然后用什么功能可以让它们与周围原子间自动生成键桥？
目的是行成一种按照原子数配比的随机Al、O的分子模型。
如下图是几何优化后的结构，没有任何化学键还。

几何优化后的随机原子结构
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2011-11-01 21:34:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wzbhit

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
ghcacj(金币+2): 谢谢 2011-11-03 09:53:57
build->Bond->Bond calculation->calculated一下就可以了
赞一下(1人) 回复此楼
从明天开始坚持吃早饭呀！
2楼2011-11-01 22:48:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jin9090900

铜虫 (小有名气)
谢谢，已经试过，还是没能成键。我分析到了问题所在，原子几何最优化后，不一定就会行成4面体结构，可能原子之间距离太短或者太远，造成没法生成化学键。我还是带着化学键来试试看吧。

不过带上化学键后，AL，O比例就不太确定了。
赞一下 回复此楼
3楼2011-11-02 08:37:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wzbhit

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
jin9090900(金币+2): 2011-11-03 10:21:24
zh1987hs(金币+3): 谢谢 2011-11-03 19:11:54
引用回帖:
3楼: Originally posted by jin9090900 at 2011-11-02 08:37:28:
谢谢，已经试过，还是没能成键。我分析到了问题所在，原子几何最优化后，不一定就会行成4面体结构，可能原子之间距离太短或者太远，造成没法生成化学键。我还是带着化学键来试试看吧。

不过带上化学键后，AL， ...

几何结构优化后，再动力学弛豫一下，然后在calculate Bond就可以了
赞一下(1人) 回复此楼
从明天开始坚持吃早饭呀！
4楼2011-11-03 10:00:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jin9090900

铜虫 (小有名气)
谢谢，请问如何进行动力学弛豫？
赞一下 回复此楼
5楼2011-11-03 10:21:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wzbhit

至尊木虫 (著名写手)
★
zh1987hs(金币+1): 谢谢 2011-11-03 19:12:03
引用回帖:
5楼: Originally posted by jin9090900 at 2011-11-03 10:21:58:
谢谢，请问如何进行动力学弛豫？

针对你的体系 dynamics 一下就行了
赞一下(1人) 回复此楼
从明天开始坚持吃早饭呀！
6楼2011-11-03 10:25:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jin9090900

铜虫 (小有名气)
好的，我试试看，谢谢您！
赞一下 回复此楼
7楼2011-11-03 11:22:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

victoria7850

金虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by jin9090900 at 2011-11-03 10:21:58:
谢谢，请问如何进行动力学弛豫？

我还是不懂。
我是菜鸟，能说得再详细点嘛？谢谢~~
赞一下 回复此楼
8楼2011-11-08 09:48:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 jin9090900 的主题更新
81/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 333求调剂 +3 文思客 2026-03-16 7/350 2026-03-16 18:21 by 文思客
[考研] 0703化学调剂 +6 妮妮ninicgb 2026-03-15 9/450 2026-03-16 16:40 by houyaoxu
[考研] 0703一志愿211 285分求调剂 +5 ly3471z 2026-03-13 5/250 2026-03-16 16:16 by 哦哦123
[考研] 材料与化工专硕调剂 +3 heming3743 2026-03-16 3/150 2026-03-16 15:05 by peike
[考研] 308求调剂 +3 是Lupa啊 2026-03-16 3/150 2026-03-16 10:07 by 求调剂zz
[考研] 0856专硕279求调剂 +5 加油加油！? 2026-03-15 5/250 2026-03-15 11:58 by 2020015
[考研] 268求调剂 +5 一定有学上- 2026-03-14 6/300 2026-03-14 22:20 by 运气yunqi
[基金申请] 面上和青基一样限30页不合理 +5 wowsunflower 2026-03-10 7/350 2026-03-14 17:21 by kingkocxr
[考研] 297求调剂 +4 学海漂泊 2026-03-13 4/200 2026-03-14 11:51 by 热情沙漠
[考研] 266求调剂 +4 学员97LZgn 2026-03-13 4/200 2026-03-14 08:37 by zhukairuo
[考研] 307求调剂 +7 超级伊昂大王 2026-03-10 7/350 2026-03-14 00:49 by JourneyLucky
[考研] 311求调剂 +8 zchqwer 2026-03-10 8/400 2026-03-14 00:01 by JourneyLucky
[考研] 279求调剂 +3 抓着星星的女孩 2026-03-10 3/150 2026-03-13 23:47 by userper
[考研] 材料与化工求调剂一志愿 985 总分 295 +8 dream…… 2026-03-12 8/400 2026-03-13 22:17 by 星空星月
[考研] 304求调剂 +7 7712b 2026-03-13 7/350 2026-03-13 21:42 by peike
[考研] 333求调剂 +3 球球古力 2026-03-11 3/150 2026-03-13 21:27 by JourneyLucky
[考研] 328化工专硕求调剂 +4 。，。，。，。i 2026-03-12 4/200 2026-03-13 14:44 by JourneyLucky
[考研] 270求调剂 085600材料与化工专硕 +3 YXCT 2026-03-11 3/150 2026-03-13 10:13 by houyaoxu
[考研] 420求调剂 +4 莫向外求11 2026-03-10 6/300 2026-03-12 14:41 by ruiyingmiao
[考研] 279求调剂 +3 莫xiao 2026-03-10 4/200 2026-03-11 08:06 by 斩魂滴兔子！
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭