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sunchenguang

金虫 (小有名气)

[求助] 求助:谁知道结构的赝对称问题怎么解决??

谁知道结构的赝对称问题怎么解决??
我做的有机物晶体结构在shelx的默认空间群Pmna解不出来 ,解得时候先降低对称性为pna21,解出来后本想通过platon再把空间群还原回去,但是platon认为空间群合适,还原不回去了,同时也认为可能有赝对称性。
已经解到没有A类错误了,解出来最小独立单元里是有3个有机物和三个DMF,然而checkcif后platon认为的分子量只有一个有机物和一个DMF,不知道我的结构解得有问题么??是否影响发表啊?
听说有个叫SAPI的程序可以解决赝对称问题,有人会使用么?
现正在写文章,比较着急啊,请大家多多帮助!O(∩_∩)O谢谢!
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megasomega

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

sunchenguang(金币+3): 2011-11-02 20:33:19
对称性的错误解释一下就可以了,不必修到没错误,addsym其实忽略了H原子以及无序部分,手性部分要慎重考虑对称性。
9楼2011-11-01 23:17:17
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ww6174

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


木瓜少爷(金币+1): 鼓励回帖交流~ 2011-10-31 20:06:06
sunchenguang(金币+3): 2011-10-31 21:39:17
sunchenguang(金币+2): 2011-11-01 09:43:25
关于分子量的问题,xpre时,改下Z值重新解试试
2楼2011-10-31 18:58:55
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sunchenguang

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by ww6174 at 2011-10-31 18:58:55:
关于分子量的问题,xpre时,改下Z值重新解试试

精修的时候Z值就是按照platon给的去修的,不知道为什么会出现这个问题哦
3楼2011-10-31 21:41:47
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cluster8676

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

sunchenguang(金币+5): 2011-11-01 09:42:40
我以前也遇到过类似的情况,用低对称空间群解出来后总是提示空间群应该更高。可是高对称空间群解出来会有好多无序的基团和原子。我后来加了TWIN和BASF命令后,发现低对称空间群占有的比例比较大。最后发表的时候还是用的低对称的空间群。
学无止境
5楼2011-11-01 00:49:54
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