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vividelife

银虫 (小有名气)

[求助] gamess的pbs脚本!

各位虫子,谁有gamess的pbs脚本文件怎么写啊,币币相谢!
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pwzhou

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

vividelife(金币+10): 非常感谢你的热心回帖,赞! 2011-10-28 16:13:49
引用回帖:
1楼: Originally posted by vividelife at 2011-10-27 23:14:02:
各位虫子,谁有gamess的pbs脚本文件怎么写啊,币币相谢!

你需要根据实际情况(比如并行用的是Socket还是MPI)修改一下Gamess自带的rungms脚本,rungms里面对PBS做了处理,然后按照正常的情况写gamess的PBS脚本即可,在PBS脚本里设置好环境变量,直接按照如下方式调用rungms即可,
rungms $INPUT 00 8 > $INPUT.log (00是你编译的时候用的版本的号码,8是CPU的个数,$INPU是输入文件名称)
2楼2011-10-28 13:07:07
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vividelife

银虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by pwzhou at 2011-10-28 13:07:07:
你需要根据实际情况(比如并行用的是Socket还是MPI)修改一下Gamess自带的rungms脚本,rungms里面对PBS做了处理,然后按照正常的情况写gamess的PBS脚本即可,在PBS脚本里设置好环境变量,直接按照如下方式调用ru ...

非常感谢!
还是不太明白,能在具体点吗!

谢谢
3楼2011-10-30 10:50:11
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xiaowu787

木虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by pwzhou at 2011-10-28 13:07:07:
你需要根据实际情况(比如并行用的是Socket还是MPI)修改一下Gamess自带的rungms脚本,rungms里面对PBS做了处理,然后按照正常的情况写gamess的PBS脚本即可,在PBS脚本里设置好环境变量,直接按照如下方式调用ru ...

同问,您好,我编译时用mpi,该怎么修改呢?我的计算环境是四个节点,每个节点四个核。谢谢
4楼2011-11-02 16:38:28
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pwzhou

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

vividelife(金币+5): 非常感谢,学习了! 2011-11-03 13:08:01
引用回帖:
4楼: Originally posted by xiaowu787 at 2011-11-02 16:38:28:
同问,您好,我编译时用mpi,该怎么修改呢?我的计算环境是四个节点,每个节点四个核。谢谢

最近很忙,没时间具体说明了,给出两个例子吧,如果要修改的话,你最好确认自己比较熟悉shell脚本和作业管理系统,否则还真是不好改。
rungms:TARGET为socket,用的Torque PBS,对应的PBS脚本为gamess.pbs
rungms_LSF:TARGET为mpi,用的是Platform LSF作业调度系统,对应的提交作业的脚本是gamess.bsub
5楼2011-11-02 19:10:22
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pwzhou

铁杆木虫 (正式写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by pwzhou at 2011-11-02 19:10:22:
最近很忙,没时间具体说明了,给出两个例子吧,如果要修改的话,你最好确认自己比较熟悉shell脚本和作业管理系统,否则还真是不好改。
rungms:TARGET为socket,用的Torque PBS,对应的PBS脚本为gamess.pbs
ru ...

再说明一下,PBS那个是最新的gamess(2001年8月的),LSF的那个是Gamess 2010年的一个版本
6楼2011-11-02 19:13:00
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xiaowu787

木虫 (正式写手)

非常感谢你提供的脚本,这样就有参考了。再次感谢
7楼2011-11-02 21:23:18
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