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vividelife

银虫 (小有名气)

[求助] gamess的pbs脚本！

各位虫子，谁有gamess的pbs脚本文件怎么写啊，币币相谢！
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1楼 2011-10-27 23:14:02
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pwzhou

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

vividelife(金币+10): 非常感谢你的热心回帖，赞！ 2011-10-28 16:13:49
引用回帖:
1楼: Originally posted by vividelife at 2011-10-27 23:14:02:
各位虫子，谁有gamess的pbs脚本文件怎么写啊，币币相谢！

你需要根据实际情况（比如并行用的是Socket还是MPI）修改一下Gamess自带的rungms脚本，rungms里面对PBS做了处理，然后按照正常的情况写gamess的PBS脚本即可，在PBS脚本里设置好环境变量，直接按照如下方式调用rungms即可，
rungms $INPUT 00 8 > $INPUT.log （00是你编译的时候用的版本的号码，8是CPU的个数，$INPU是输入文件名称）
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2楼2011-10-28 13:07:07
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vividelife

银虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by pwzhou at 2011-10-28 13:07:07:
你需要根据实际情况（比如并行用的是Socket还是MPI）修改一下Gamess自带的rungms脚本，rungms里面对PBS做了处理，然后按照正常的情况写gamess的PBS脚本即可，在PBS脚本里设置好环境变量，直接按照如下方式调用ru ...

非常感谢！
还是不太明白，能在具体点吗！

谢谢
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3楼2011-10-30 10:50:11
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xiaowu787

木虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by pwzhou at 2011-10-28 13:07:07:
你需要根据实际情况（比如并行用的是Socket还是MPI）修改一下Gamess自带的rungms脚本，rungms里面对PBS做了处理，然后按照正常的情况写gamess的PBS脚本即可，在PBS脚本里设置好环境变量，直接按照如下方式调用ru ...

同问，您好，我编译时用mpi，该怎么修改呢？我的计算环境是四个节点，每个节点四个核。谢谢
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4楼2011-11-02 16:38:28
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pwzhou

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

vividelife(金币+5): 非常感谢，学习了！ 2011-11-03 13:08:01
引用回帖:
4楼: Originally posted by xiaowu787 at 2011-11-02 16:38:28:
同问，您好，我编译时用mpi，该怎么修改呢？我的计算环境是四个节点，每个节点四个核。谢谢

最近很忙，没时间具体说明了，给出两个例子吧，如果要修改的话，你最好确认自己比较熟悉shell脚本和作业管理系统，否则还真是不好改。
rungms：TARGET为socket，用的Torque PBS，对应的PBS脚本为gamess.pbs
rungms_LSF：TARGET为mpi，用的是Platform LSF作业调度系统，对应的提交作业的脚本是gamess.bsub
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5楼2011-11-02 19:10:22
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pwzhou

铁杆木虫 (正式写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by pwzhou at 2011-11-02 19:10:22:
最近很忙，没时间具体说明了，给出两个例子吧，如果要修改的话，你最好确认自己比较熟悉shell脚本和作业管理系统，否则还真是不好改。
rungms：TARGET为socket，用的Torque PBS，对应的PBS脚本为gamess.pbs
ru ...

再说明一下，PBS那个是最新的gamess（2001年8月的），LSF的那个是Gamess 2010年的一个版本
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6楼2011-11-02 19:13:00
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xiaowu787

木虫 (正式写手)
非常感谢你提供的脚本，这样就有参考了。再次感谢
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7楼2011-11-02 21:23:18
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