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Sofia1004

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[求助] 如何快速找到所有膜蛋白

我的老板让我把解淀粉芽孢杆菌的所有膜蛋白找到，我在NCBI 上一看，解淀粉芽孢杆菌的基因组有391万bp啊，一个一个的看是不是膜蛋白得弄到猴年马月啊，求高人指点怎么高效的筛选出所有的膜蛋白啊？

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1楼 2011-10-25 10:15:39

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Sofia1004

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wanhscn: 预测的两种可能性！ 2011-10-27 11:05:55

引用回帖:

8楼: Originally posted by wanhscn at 2011-10-25 21:21:32:
通过比对预测它是膜蛋白 hypothetical （假定的有可能的）membrane protein [Bacillus amyloliquefaciens FZB42]
因此有两个可能的结构域也很正常
第一个是从aa 28到aa354 预测为Predicted permease, membe ...

谢谢！那个蛋白的氨基酸数目不是360吗，为什么两个Region结构域的区域范围有重叠啊，一个是从28到354，一个是从40到342？