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旭日and东升

新虫 (小有名气)

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虫号: 1453617
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专业: 生物信息学

[求助] linux下运行python报错，不知原因已有1人参与

我写了一个小python程序，在windows下运行的很好，但放在linux环境下却报错了。不知道什么原因。
window下的python版本是2.7；而linux下的python版本是2.4。
报错代码如下：
Traceback (most recent call last):
  File "align_new.py", line 213, in ?
score=smith_waterman(seq,seq[j],BLOSUM62)
  File "align_new.py", line 61, in smith_waterman
score_diagonal=score[i-1][j-1]+match_score(seq1[i-1],seq2[j-1],BLOSUM62)
  File "align_new.py", line 34, in match_score
y=alphabet[beta]
KeyError: '\r'
这个错误看不懂，语法缩进都没问题，在window下也能正常运行，求各位大神指导一下，到底哪儿出了问题？
谢谢

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1楼 2011-10-22 17:15:33

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

nodexy

新虫 (初入文坛)

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专业: 生物信息学

【答案】应助回帖

★ ★
余泽成(金币+2): 谢谢参与应助！欢迎常来程序语言版！ 2011-10-28 23:23:24

1 LZ可能是linux新手和python新手，呵呵，这种问题是新手最常遇到的；
2 linux和windows对换行符的定义不同，这些在学习linux时就该了解，/r和/n的具体含义也最好清楚；
3 python是我个人很推荐的语言，搞生物信息现在都推荐学python，perl只要能看懂别人的代码即可，呵；当然这不是语言之争，只是建议；完全可以二者都学，然后自己选择适合的