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真菌建树遇到瓶颈了
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| 自己摸索建树，实验室其他人都不做这个方面，我想在此请教一下大家：真菌建树时的模式菌株怎么找？最后使用的图谱是拓扑图还是建树时直接计算出来的图谱？在转换为ALN格式时还需要将序列不同的部分比较多的菌种进行修改吗？是不是要将这一部分忽略？希望专家能给我答疑，谢谢~ |
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天鸟
木虫 (正式写手)
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- 专业: 环境微生物学
【答案】应助回帖
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你可以看看你的那个属的菌在International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology杂志中是否有，因为这个杂志很多是报道新菌的，你可以参考下。你建出来的phylogenetic tree图一般是用“邻接法”建树。 可参照帖子：http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=2990568 |
2楼2011-10-21 15:13:24