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贺仪

铁杆木虫 (著名写手)

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[求助] GAUSSIAN怎么计算overlap matrix？

本人非专业GAUSSIAN使用者，请问GAUSSIAN怎么计算overlap matrix ， molecular orbital coefficients and energies ？如果可以，请列出输入文件，谢谢！

F0= SCC
,没法显示……
where S is the intermolecular overlap matrix, and C and
are the dimer Kohn-Sham orbital’s coefﬁcients and energies.
The noninteracting molecular orbitals of the two individual
molecules are calculated separately by the standard self-
consistent ﬁeld procedure. These noninteracting orbitals are
then used to construct the dimer Kohn-Fock matrix. Namely,
it takes directly the unperturbed individual molecule’s orbital
and density matrix to guarantee that originally, the two mol-
ecules are noninteracting, and only when putting them to-
gether, one can get interaction information with respect to
the individual molecules in the spirit of ﬁrst-order perturba-
tion. All of the calculations are performed with the GAUSSIAN
03 package

详细的请看PHYSICAL REVIEW B 79, 115203 2009

[ Last edited by 贺仪 on 2011-10-17 at 16:20 ]

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嘟啦啦嘟啦啦嘟

1楼2011-10-17 11:00:34

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贺仪

铁杆木虫 (著名写手)

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引用回帖:

31楼: Originally posted by zhou2009 at 2011-10-19 14:27:25:
至此，经过讨论，似乎问题解决得差不多了，你要的“两个分子homo之间的overlap integral”从理论方法上也说明白了。

然而跳出你的提问看，这个问题还是有问题。
因为一般说来，对于A、B分子之间的作用，绝对不 ...

因为一般说来，对于A、B分子之间的作用，绝对不是A分子HOMO与B分子HOMO之间在作用，形成的超分子AB的HOMO也绝对不是A分子的HOMO与B分子的HOMO所形成的。
A、B分子之间要起作用，只能是一个分子的HOMO与另一个分子的LUMO起作用。

这个说的太绝对了，a分子的任何轨道和b分子的任何轨道都会有作用，只是大小问题。

举个例子也许就能说明白：
如H2O分子的HOMO是O的孤对电子，而两个H2O分子之间相互作用，不是指这两个H2O分子之间HOMO相互作用，这样只有双方孤对电子的排斥。
排斥之后、翻转、优化，会形成氢键。形成的氢键因能量降低MO会下沉。AB的HOMO是另一个H2O分子的O的孤对电子。

你说的这些也没什么问题，但是你不能否定我计算考虑的是没有意义的，如果你想知道有什么意义，请查看Marcus的理论吧，里面几乎所有的公式都有，在化学反应速率，以及光谱等相关的应用还是很多的，不然也不会获诺贝尔奖的