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贺仪

铁杆木虫 (著名写手)

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[求助] GAUSSIAN怎么计算overlap matrix？

本人非专业GAUSSIAN使用者，请问GAUSSIAN怎么计算overlap matrix ， molecular orbital coefficients and energies ？如果可以，请列出输入文件，谢谢！

F0= SCC
,没法显示……
where S is the intermolecular overlap matrix, and C and
are the dimer Kohn-Sham orbital’s coefﬁcients and energies.
The noninteracting molecular orbitals of the two individual
molecules are calculated separately by the standard self-
consistent ﬁeld procedure. These noninteracting orbitals are
then used to construct the dimer Kohn-Fock matrix. Namely,
it takes directly the unperturbed individual molecule’s orbital
and density matrix to guarantee that originally, the two mol-
ecules are noninteracting, and only when putting them to-
gether, one can get interaction information with respect to
the individual molecules in the spirit of ﬁrst-order perturba-
tion. All of the calculations are performed with the GAUSSIAN
03 package

详细的请看PHYSICAL REVIEW B 79, 115203 2009

[ Last edited by 贺仪 on 2011-10-17 at 16:20 ]

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嘟啦啦嘟啦啦嘟

1楼 2011-10-17 11:00:34

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beefly

专家顾问 (职业作家)

地沟油冶炼专家

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管辖: 计算模拟

【答案】应助回帖

贺仪(金币+5): 回答的差不多了，呵呵，还希望你继续关注下面的问题！谢谢咯 2011-10-17 21:38:54

“按照你们的方法算出来的是一个体系不同轨道间的overlap，还不一样。”

通常是如此。

“算两个分子homo之间的overlap integral”

如果用gaussian等现成的程序算，首先算超分子，分析HOMO附近的占居轨道，找到对应两个分子各自HOMO的轨道，记住轨道编号i和j，然后看重叠矩阵的矩阵元S(i,j)或S(j,i)