应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » GAUSSIAN怎么计算overlap matrix？
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
52/1返回列表
查看: 2401  |  回复: 31
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

贺仪

铁杆木虫 (著名写手)

[求助] GAUSSIAN怎么计算overlap matrix？

本人非专业GAUSSIAN使用者，请问GAUSSIAN怎么计算overlap matrix ， molecular orbital coefficients and energies ？如果可以，请列出输入文件，谢谢！

F0= SCC
,没法显示……
where S is the intermolecular overlap matrix, and C and 
are the dimer Kohn-Sham orbital’s coefficients and energies.
The noninteracting molecular orbitals of the two individual
molecules are calculated separately by the standard self-
consistent field procedure. These noninteracting orbitals are
then used to construct the dimer Kohn-Fock matrix. Namely,
it takes directly the unperturbed individual molecule’s orbital
and density matrix to guarantee that originally, the two mol-
ecules are noninteracting, and only when putting them to-
gether, one can get interaction information with respect to
the individual molecules in the spirit of first-order perturba-
tion. All of the calculations are performed with the GAUSSIAN
03 package

详细的请看PHYSICAL REVIEW B 79, 115203 2009

[ Last edited by 贺仪 on 2011-10-17 at 16:20 ]
回复此楼

» 猜你喜欢
嘟啦啦嘟啦啦嘟
1楼 2011-10-17 11:00:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

beefly

专家顾问 (职业作家)

地沟油冶炼专家

【答案】应助回帖

贺仪(金币+5): 回答的差不多了，呵呵， 还希望你继续关注下面的问题！谢谢咯 2011-10-17 21:38:54
“按照你们的方法算出来的是一个体系不同轨道间的overlap，还不一样。”

通常是如此。

“算两个分子homo之间的overlap integral”

如果用gaussian等现成的程序算，首先算超分子，分析HOMO附近的占居轨道，找到对应两个分子各自HOMO的轨道，记住轨道编号i和j，然后看重叠矩阵的矩阵元S(i,j)或S(j,i)
赞一下 回复此楼
beefly《西太平洋大学现代英汉词典》[bi:fli]牛肉一般地
12楼2011-10-17 19:56:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 32 个回答

beefly

专家顾问 (职业作家)

地沟油冶炼专家

【答案】应助回帖

★ ★
ben_ladeng(金币+2): 专家考核存档 2011-10-17 11:48:43
贺仪(金币+5): 谢谢 2011-10-17 14:46:34
iop(3/33=2)：打印重叠矩阵，以及其他矩阵的信息
pop=full：打印全部轨道因子。
默认打印hf/dft级别的轨道能量
赞一下(1人) 回复此楼
beefly《西太平洋大学现代英汉词典》[bi:fli]牛肉一般地
2楼2011-10-17 11:26:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhou2009

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
ben_ladeng(金币+2): 谢谢斑竹 2011-10-17 11:49:06
贺仪(金币+5): 谢谢，还是有点问题…… 2011-10-17 14:46:24
既是非专业GAUSSIAN使用者，你是问如何在输出结果中得到相应的数据吧。

加关键词：Pop=Full，得到：molecular orbital coefficients and energies

加关键词：iop(3/33=1)，得到：overlap matrix
赞一下(1人) 回复此楼
3楼2011-10-17 11:26:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

beefly

专家顾问 (职业作家)

地沟油冶炼专家

【答案】应助回帖

★ ★
ben_ladeng: 专家考核存档 2011-10-17 11:49:17
zhou2009(金币+2): 2011-10-17 12:43:57
贺仪(金币+5): 谢谢，还是有点问题…… 2011-10-17 14:46:15
如果你问“怎么计算overlap matrix”：gaussian至少有两种算法。iop(3/38=2)用标准公式算。目前默认的prism方法很繁琐，思路是先把所有积分转化成标准的双电子积分一般公式，然后用统一的方法计算，有点画蛇添足的感觉。
赞一下(2人) 回复此楼
beefly《西太平洋大学现代英汉词典》[bi:fli]牛肉一般地
4楼2011-10-17 11:31:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 32 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 一志愿中海洋320化学工程与技术学硕求调剂 +8 披星河 2026-03-30 8/400 2026-03-31 08:53 by lbsjt
[考研] 083000学硕274求调剂 +11 Li李鱼 2026-03-26 11/550 2026-03-31 08:24 by jp9609
[考研] 085601一志愿中山大学深圳材料工程330求调剂 +5 pipiver 2026-03-30 5/250 2026-03-31 07:37 by JourneyLucky
[考研] 生物学学硕，一志愿湖南大学，初试成绩338 +7 YYYYYNNNNN 2026-03-26 9/450 2026-03-30 20:29 by YYYYYNNNNN
[考研] 317分 一志愿南理工材料工程 本科湖工大 求调剂 +12 芋泥小铃铛 2026-03-28 12/600 2026-03-30 17:06 by wangjy2002
[考研] 329求调剂，一志愿西北工业大学，材料工程（085601） +5 小小机灵虫 2026-03-29 11/550 2026-03-30 15:02 by Wang200018
[考研] 298求调剂 +3 什么是胖头鱼 2026-03-30 5/250 2026-03-30 14:41 by 青海小西牛
[考研] 070300化学354求调剂 +7 101次希望 2026-03-28 7/350 2026-03-30 13:22 by Iveryant
[考研] 085701求调剂初试286分 +5 secret0328 2026-03-28 5/250 2026-03-30 12:54 by fangnagu
[考研] 375求调剂 +6 雨夏整夜 2026-03-29 6/300 2026-03-30 10:21 by herarysara
[考研] 298求调剂 +3 种圣赐 2026-03-29 3/150 2026-03-29 12:06 by longlotian
[考研] 279求调剂 +4 蝶舞轻绕 2026-03-29 4/200 2026-03-29 09:45 by laoshidan
[考研] 085600，专业课化工原理，321分求调剂 +5 大馋小子 2026-03-28 5/250 2026-03-29 08:56 by qingfeng258
[考研] 305求调剂 +8 RuiFairyrui 2026-03-28 8/400 2026-03-29 08:22 by fmesaito
[考研] 321求调剂 +7 璞玉~~ 2026-03-25 8/400 2026-03-29 06:41 by 544594351
[考研] 071000生物学求调剂，初试成绩343 +7 小小甜面团 2026-03-25 7/350 2026-03-28 20:25 by 唐沐儿
[考研] 286求调剂 +4 丢掉懒惰 2026-03-27 7/350 2026-03-28 08:07 by baoball
[考研] 化学调剂 +4 爱吃番茄的旭 2026-03-24 5/250 2026-03-27 17:50 by kiokin
[考研] 安徽大学专硕生物与医药专业(086000)324分，英语已过四六级，六级521，求调剂 +4 美味可乐鸡翅 2026-03-26 4/200 2026-03-27 15:27 by 星空星月
[考研] 351求调剂 +4 麦克阿磊 2026-03-24 4/200 2026-03-27 00:32 by wxiongid
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭