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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » 量化新手直通车 » 关于反应机理的研究，多大体系是极限？
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gebitingqin

铁虫 (小有名气)

[求助] 关于反应机理的研究，多大体系是极限？

问题：粗粗看了一下，大家提到的反应机理研究涉及的都是小分子或者过渡金属，一般较大的有机分子行不行呢？比如碳原子在20个左右，芳环结构占主要部分，柔性不大的分子，反应机理已有猜测，缺少证据，做反应机理有没有可能？为什么不行？
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做事情有明确的目的和充分的准备
1楼 2011-10-16 11:01:32
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recoli

金虫 (正式写手)
★
小红豆(金币+1): 谢谢 2011-10-16 21:50:33
人家做酶催化的，一两百个轻原子（碳氢氧氮之类）不成问题。少量重原子也可以用赝势处理。
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2楼2011-10-16 18:06:40
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gebitingqin

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by recoli at 2011-10-16 18:06:40:
人家做酶催化的，一两百个轻原子（碳氢氧氮之类）不成问题。少量重原子也可以用赝势处理。

请问卤素是重原子吗？我还一直以为重原子是非氢原子，好多地方都这么说的呢。
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做事情有明确的目的和充分的准备
3楼2011-10-16 20:32:13
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recoli

金虫 (正式写手)
★
zhou2009(金币+1): 2011-10-18 15:31:24
轻重原子看你怎么说了，只要说清楚了就行，这个不是个定义。

我回帖里的重原子，指的是过渡金属原子。
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4楼2011-10-17 12:41:35
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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

优秀版主
★ ★
zhou2009(金币+2): 2011-10-18 15:32:38
引用回帖:
4楼: Originally posted by recoli at 2011-10-17 12:41:35:
轻重原子看你怎么说了，只要说清楚了就行，这个不是个定义。

我回帖里的重原子，指的是过渡金属原子。

貌似在理论界，重原子指的就是氦原子及更重的原子
不过这东西只要定义好的就行，不纠结
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5楼2011-10-17 14:15:24
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zpf8813

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

gebitingqin(金币+1): 2011-10-17 20:06:13
啊哈 20个左右碳原子 还由卤素原子 难道做二噁英的么
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6楼2011-10-17 16:56:30
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recoli

金虫 (正式写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by yjcmwgk at 2011-10-17 14:15:24:
貌似在理论界，重原子指的就是氦原子及更重的原子
不过这东西只要定义好的就行，不纠结

哈，卒长又开始活跃了
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7楼2011-10-17 17:50:22
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gebitingqin

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by recoli at 2011-10-17 17:50:22:
哈，卒长又开始活跃了

看来卒长是大腕啊，那能否给点帮助，比如推荐一篇文献之类的
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做事情有明确的目的和充分的准备
8楼2011-10-17 21:12:52
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gebitingqin

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by zpf8813 at 2011-10-17 16:56:30:
啊哈 20个左右碳原子 还由卤素原子 难道做二噁英的么

不是，是咔啉
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做事情有明确的目的和充分的准备
9楼2011-10-18 13:54:43
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yongleli

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

gebitingqin(金币+1): 谢谢解惑！ 2011-10-19 12:05:13
引用回帖:
1楼: Originally posted by gebitingqin at 2011-10-16 11:01:32:
问题：粗粗看了一下，大家提到的反应机理研究涉及的都是小分子或者过渡金属，一般较大的有机分子行不行呢？比如碳原子在20个左右，芳环结构占主要部分，柔性不大的分子，反应机理已有猜测，缺少证据，做反应机理有 ...

我跟人合作的机理是一个180多个原子的体系，M06完全无压力。
当然，总共动用了用几十个CPU，算了大半年吧。
其中最闹心一个计算是用RIMP2作比较计算，
8CPU算了3个月才算完一个优化。
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10楼2011-10-19 12:00:34
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