应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » rmsf的计算
51/1返回列表
查看: 2280  |  回复: 5
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

zhulijuan001

金虫 (小有名气)

[求助] rmsf的计算

用AMBER能够计算每个原子和每个残基的RMSF，但是我想计算每帧的RMSF，大家有什么办法吗？
回复此楼

» 猜你喜欢
1楼 2011-10-14 11:54:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhulijuan001

金虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by fmtzhangli at 2011-10-14 13:37:33:
RMSF指的是平均构像的涨落，一帧能计算RMSF吗？ 建议你看一下RMSF的定义

rmsf的定义是相对于平均结构的涨落吧，求每个原子的RMSF是得到在一段时间内原子的平均位置，然后求每一帧相对于平均位置的涨落，那求总的RMSF的时候不可以求得在一段时间内的平均结构，再求出每一帧相对于平均结构的涨落吗？
赞一下 回复此楼
4楼2011-10-17 10:01:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答

fmtzhangli

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
zh1987hs(金币+2): 有道理 2011-10-15 22:56:44
RMSF值得是平均构像的涨落，一帧能计算RMSF吗？
赞一下(1人) 回复此楼
2楼2011-10-14 13:36:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fmtzhangli

金虫 (小有名气)
★
zh1987hs(金币+1): 谢谢 2011-10-15 22:56:50
RMSF指的是平均构像的涨落，一帧能计算RMSF吗？ 建议你看一下RMSF的定义
赞一下(1人) 回复此楼
3楼2011-10-14 13:37:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fmtzhangli

金虫 (小有名气)
★
ghcacj(金币+1): 谢谢 2011-10-17 13:28:36
引用回帖:
4楼: Originally posted by zhulijuan001 at 2011-10-17 10:01:57:
rmsf的定义是相对于平均结构的涨落吧，求每个原子的RMSF是得到在一段时间内原子的平均位置，然后求每一帧相对于平均位置的涨落，那求总的RMSF的时候不可以求得在一段时间内的平均结构，再求出每一帧相对于平均结 ...

那值得应该是RMSD
赞一下(1人) 回复此楼
5楼2011-10-17 10:14:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭