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Illusionist银虫 (正式写手)
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如何用dmol3计算两个分子相互作用。
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想要计算两个含有苯环的平面结构的有机分子相互作用 结果发现两个分子靠近后总能量并没有减少。 不知道是哪里设置有问题。 难道和对称性有关么？还是什么 急需求解！ 不胜感激。 距离3.3A左右 使用的是MS5.5 DMOL3模块。 首先进行了几何优化： # Task parameters Calculate optimize Opt_energy_convergence 1.0000e-005 Opt_gradient_convergence 2.0000e-003 A Opt_displacement_convergence 5.0000e-003 A Opt_iterations 50 Opt_max_displacement 0.3000 A Initial_hessian improved Symmetry on Max_memory 2048 # Electronic parameters Spin_polarization restricted Charge 0 Basis dnp Pseudopotential none Functional gga(p91) Aux_density octupole Integration_grid fine Occupation fermi Cutoff_Global 3.7000 angstrom Scf_density_convergence 1.0000e-006 Scf_charge_mixing 0.2000 Scf_iterations 50 Scf_diis 6 pulay # Print options Print eigval_last_it # Calculated properties 然后计算能量 # Task parameters Calculate energy Symmetry on Max_memory 2048 # Electronic parameters Spin_polarization restricted Charge 0 Basis dnp Pseudopotential none Functional pwc Harris off Aux_density octupole Integration_grid fine Occupation fermi Cutoff_Global 3.7000 angstrom Scf_density_convergence 1.0000e-006 Scf_charge_mixing 0.2000 Scf_iterations 50 Scf_diis 6 pulay # Print options Print eigval_last_it # Calculated properties 结果显示， 单个分子的总能量： Energy components: Sum of atomic energies = -1195.7413022Ha Kinetic = -12.9964458Ha Electrostatic = -0.8916723Ha Exchange-correlation = 3.0765993Ha Spin polarization = 2.0531628Ha 两个分子的总能量： Energy components: Sum of atomic energies = -2391.4826044Ha Kinetic = -25.1271925Ha Electrostatic = -2.6622324Ha Exchange-correlation = 6.1452670Ha Spin polarization = 4.1063257Ha 这样一来，两个分子的总能量并没有减少，就好象这两个分子并没有作用一样。 不知道怎么回事？ |
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