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beibeili

禁虫 (初入文坛)

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zxl523

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
御剑江湖(金币+2): 谢谢 2011-09-29 17:09:03
beibeili(金币+2): 2011-10-09 09:39:22
参考一些固定电荷的文献,有的提到。譬如杨忠志的一些论文。
itisagoodtime.
2楼2011-09-28 10:27:36
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fcenf

木虫 (初入文坛)

试过INACTIVE了吗?
http://home.ustc.edu.cn/~fucf
3楼2011-09-28 10:58:01
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beibeili

禁虫 (初入文坛)

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4楼2011-10-09 09:37:57
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ChemiAndy

木虫 (正式写手)


★ ★ ★ ★
ghcacj(金币+4): 谢谢 2011-10-10 17:47:24
楼主再仔细检查一下,Inactive是正解。

我测试过的,不动的原子与运动原子之间的相互作用是计算的。你可以用包里的example/amoeba.xyz做个测试,那是两个水分子,你固定其中一个水分子跑NVT MD(T=50K)看看,另外一个是被吸在固定分子上的,这说明二者的相互作用是计算的。
5楼2011-10-10 13:06:18
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beibeili

禁虫 (初入文坛)

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6楼2011-10-12 18:48:49
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wx3266626

银虫 (小有名气)

楼主,您好!小弟初学tinker,想做tinker的md模拟,请问您有什么资料吗?分享一份吧,谢谢啦
7楼2015-07-16 12:22:37
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