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zhaolijunzly

金虫 (小有名气)

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[交流] 引物

大家帮忙看看这对引物能用吗？
上游引物：5‘-CGGGATCCACCGACCGTGCT-3’
下游引物：5‘-CGGAATTCCGCAACGCTCGC-3’
谢谢！

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zhaolijunzly

zhaolijunzly

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1楼 2011-09-21 15:36:09

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zhaolijunzly

金虫 (小有名气)

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送鲜花一朵

好的，谢谢了，我在网上下载一个试试吧

5楼2011-09-21 16:21:14

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imfly77

木虫 (小有名气)

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★
zhaolijunzly(金币+1):谢谢参与

分析引物，主要还是看错配（false priming）。你可以自己用oligo分析下错配情况。
另外，发卡和二聚体情况不严重。如果可以的话，降一下上游引物的GC含量（把5‘端两个保护碱基换成AT）

赞一下(1人)

2楼2011-09-21 15:42:11

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zhaolijunzly

金虫 (小有名气)

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送鲜花一朵

好的，那我在上游引物的前面加上TAAT，在下游引物的前面加上ATAA，我看这样就把GC含量降下来了，我主要是不会分析上下游引物之间会不会形成二聚体，Primer5.0我不太会用，只会分析一条链的。

3楼2011-09-21 16:04:38

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imfly77

木虫 (小有名气)

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★ ★ ★
西瓜(金币+3): 很热心 2011-09-21 17:28:57

用oligo 6.0吧。简单的很。
二聚体情况不严重，

赞一下(1人)

4楼2011-09-21 16:09:27

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