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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 引物
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zhaolijunzly

金虫 (小有名气)

[交流] 引物

大家帮忙看看这对引物能用吗？
上游引物：5‘-CGGGATCCACCGACCGTGCT-3’
下游引物：5‘-CGGAATTCCGCAACGCTCGC-3’
谢谢！
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zhaolijunzly zhaolijunzly

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1楼 2011-09-21 15:36:09
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zhaolijunzly

金虫 (小有名气)
送鲜花一朵
好的，那我在上游引物的前面加上TAAT，在下游引物的前面加上ATAA，我看这样就把GC含量降下来了，我主要是不会分析上下游引物之间会不会形成二聚体，Primer5.0我不太会用，只会分析一条链的。
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3楼2011-09-21 16:04:38
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imfly77

木虫 (小有名气)
★
zhaolijunzly(金币+1):谢谢参与
分析引物，主要还是看错配（false priming）。你可以自己用oligo分析下错配情况。
另外，发卡和二聚体情况不严重。如果可以的话，降一下上游引物的GC含量（把5‘端两个保护碱基换成AT）
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2楼2011-09-21 15:42:11
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imfly77

木虫 (小有名气)
★ ★ ★
西瓜(金币+3): 很热心 2011-09-21 17:28:57
用oligo 6.0吧。简单的很。
二聚体情况不严重，
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4楼2011-09-21 16:09:27
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zhaolijunzly

金虫 (小有名气)
送鲜花一朵
好的，谢谢了，我在网上下载一个试试吧
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5楼2011-09-21 16:21:14
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