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zhaolijunzly

金虫 (小有名气)


[交流] 引物

大家帮忙看看这对引物能用吗?
上游引物:5‘-CGGGATCCACCGACCGTGCT-3’
下游引物:5‘-CGGAATTCCGCAACGCTCGC-3’
谢谢!
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imfly77

木虫 (小有名气)



zhaolijunzly(金币+1):谢谢参与
分析引物,主要还是看错配(false priming)。你可以自己用oligo分析下错配情况。
另外,发卡和二聚体情况不严重。如果可以的话,降一下上游引物的GC含量(把5‘端两个保护碱基换成AT)
2楼2011-09-21 15:42:11
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zhaolijunzly

金虫 (小有名气)


送鲜花一朵
好的,那我在上游引物的前面加上TAAT,在下游引物的前面加上ATAA,我看这样就把GC含量降下来了,我主要是不会分析上下游引物之间会不会形成二聚体,Primer5.0我不太会用,只会分析一条链的。
3楼2011-09-21 16:04:38
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imfly77

木虫 (小有名气)


★ ★ ★
西瓜(金币+3): 很热心 2011-09-21 17:28:57
用oligo 6.0吧。简单的很。
二聚体情况不严重,
4楼2011-09-21 16:09:27
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zhaolijunzly

金虫 (小有名气)


送鲜花一朵
好的,谢谢了,我在网上下载一个试试吧
5楼2011-09-21 16:21:14
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