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梨花问雪

金虫 (正式写手)

[求助] 请问粉末法解晶体结构的一些问题

一般晶体结构解析需要培养单晶,但是我研究的课题怎么都培养不出单晶。看到相关领域内的文献基本上用的都是ab initio法解晶体结构。
我想问,
1)粉末法解晶体结构所需的粉末XRD是不是一般的粉末XRD就行?要不要特殊的同步辐射光源等
2)如果可以的话,国内有谁会这个呢? 如果有的话,大概解一个样品多少钱呢?

谢谢哦。见笑了。
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xujun16

银虫 (著名写手)

您好!

是什么化合物?
3楼2011-09-16 11:14:51
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patriot_csu

至尊木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
梨花问雪(金币+2): 谢谢应助。您的回答对我很有帮助。 2011-09-16 15:51:56
xujun16(金币+5, CMEI+1): 谢谢您的帮助! 2011-09-16 19:10:28
首先要确定的是,你合成的这个是不是已知结构,或者说是已知的framework.建议:

先弄一下物相鉴定,或者看看 M.M.J. Treacy and J.B. Higgins, Collection of Simulated XRD Powder Diffraction Patterns for Zeolites, 5th revised edition , Elsevier, Amsterdam, 2007 这本书,有pdf电子版本的。或者沸石分子筛数据库 http://www.iza-structure.org/databases/。比对一下你的粉末衍射图谱和已知topology的分子筛的模拟衍射图谱。虽然模拟衍射图谱都是基于全 Si 的 framework的,而你的framework是phosphate (我估计含Ti, Zn不会特别多,它们占 1-2个 T atoms in asymmetric unit 充顶了),所以在物相鉴定层次上,可以不计较差别。

或者我还建议你把你的 as-made 的样品 calcine 一下,这样可以除去样品里的水和有机template(当然前提条件是不让你的framework collapse)。然后再测样品的粉末图谱。比较一下两者结晶性的差别。如果差别不大的话,建议用calcine后的图谱作为结构解析。因为这样你就先不用考虑你样品的空洞中有机物的位置了,可以先解出framework structure,再通过差值傅立叶变化和Rietveld精修来确定有机模板在结构中的位置。

如果要做粉末结构从头解的话,最近一些年出了一个新方法叫做"charge flipping",对于解析粉末多孔材料非常有效。有一个免费的软件叫做Superflip,比较好用。如果想了解更多细节的话,建议在web of science上搜索主题 “zeolite” 加上 “charge flipping”。

祝你好运!
6楼2011-09-16 15:29:53
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普通回帖

179510317

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

梨花问雪(金币+1): 谢谢您。 2011-09-16 10:53:47
据说国内只有几个人会用这个方法解啊,很难,建议你不要用这个方法,很不现实。
2楼2011-09-16 10:47:49
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梨花问雪

金虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by xujun16 at 2011-09-16 11:14:51:
您好!

是什么化合物?

您好,是分子筛。骨架还有Zn, Ti, P, O, 孔道中为 环状有机胺吗啉 (对氧氮环己环)
4楼2011-09-16 11:40:06
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383639931

银虫 (著名写手)


【答案】应助回帖

梨花问雪(金币+1): 谢谢应助。 2011-09-16 14:03:38
这种方法我分享的资源里面有相关文献,但是貌似很复杂,XRD要进步扫描,解起来软件也不好搞到手。
5楼2011-09-16 12:59:41
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梨花问雪

金虫 (正式写手)

引用回帖:
6楼: Originally posted by patriot_csu at 2011-09-16 15:29:53:
首先要确定的是,你合成的这个是不是已知结构,或者说是已知的framework.建议:

先弄一下物相鉴定,或者看看 M.M.J. Treacy and J.B. Higgins, Collection of Simulated XRD Powder Diffraction Patterns for  ...

谢谢您的回复, 看得出来您对分子筛很了解。 我的做的晶体是一个新的晶体。 还有烧的话,会掉一些结晶度, XRD图不太好。 其实用as-synthesized powder XRD做的话, 解不出模板剂没有关系。 在单晶解析时, 模板剂如果无序的话,可以忽略的。 不知道粉末行不行? charge flipping解法, 我去看看啊,谢谢您的指点啊。
7楼2011-09-16 16:07:25
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patriot_csu

至尊木虫 (正式写手)

在用粉末数据得出framework之后,确定模板剂的位置有3种做法。

一种是先不考虑有机模板,直接做差值傅立叶变换,在孔洞中的额外峰的位置设定为模板剂的位置,模板剂是看成rigid body后在孔洞中设定的初始位置,最初将占有率设定成比较小的值如0.5以下,然后先固定位置精修占有率,再固定占有率精修位置。这样即便模板剂是无序的,也可以从精修中看出来是不是真的无序。有时候模板剂并不是无序的。

或者先用分子动力学的方法找到能量最低的模板剂位置,暂定为其初始位置,然后开始用类似于上面提到的办法精修。

另外还有一种办法,就是用Platon软件里面的squeeze来去除孔洞内有机物或者水分子对粉末衍射图谱的贡献。这个办法被一些zeolite crystallographyers 推荐,但我们组并不认同,所以也从来没有用过这个办法。
8楼2011-09-16 16:55:16
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QCZ9999

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

梨花问雪(金币+6): 2011-10-24 16:52:45
先用步进法收集衍射谱图(一般的粉末XRD,确保衍射强度),再用SDPD(structure determination from powder dataq)法进行解析
9楼2011-10-20 14:07:21
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卡普那奴

金虫 (正式写手)

我也不太懂,但上课时单晶衍射实验室的老师演示过从一堆粉体中挑出单晶然后做衍射解结构的
10楼2011-12-19 23:32:32
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