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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 关于nucleotide binding（核酸结合位点）有谁知道？
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nnsulei

金虫 (正式写手)

[交流] 关于nucleotide binding（核酸结合位点）有谁知道？

本人获得一段氨基酸序列，是新物种的。想分析它的功能，不知道怎么找核酸结合位点nucleotide binding。谢谢。可以和其他物种比对查找吗？不知道是否保守呢，有个物种上的这段序列是结合位点，我这个物种上也有这段序列，能不能说这就是本物种的结合位点呢？   或者什么软件分析？
      谢谢！！！

[ Last edited by nnsulei on 2011-9-18 at 16:06 ]
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1楼 2011-09-15 08:34:06
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wanhscn

木虫 (职业作家)
★ ★ ★ ★
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nnsulei(金币+5): 2011-09-16 23:36:59
dhd997(金币+3): 2011-09-19 14:24:59
Softberry 可以分析蛋白质结构！
NCBI BlastN 可推测蛋白质的功能！
以及系统进化分析
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2楼2011-09-15 08:44:45
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nnsulei

金虫 (正式写手)
坐等内行人~~~~
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4楼2011-09-18 16:06:58
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quiller2000

木虫 (著名写手)
★ ★ ★ ★
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dhd997(金币+3): good 2011-09-19 07:53:07
nnsulei(金币+1): 谢谢。这个酶在其他物种里有被研究过，能不能根据其他物种的研究来推断我的酶的功能位点。在其他物种里这个酶的氨基酸序列里有nucleotide binding位点的几个 关键氨基酸，我想知道这个位点怎么找，是不是保守，另外它和nucleotide binding loop位点一样吗。谢谢！ 2011-09-19 08:38:49
nnsulei(金币+5): 谢谢帮助！再送5个！ 2011-09-19 08:39:22
1，你可以将你的序列进行初步的生物信息学分析，如果已经有相似序列被研究，则大致可以推知相关的功能；
2，如果是ATP/GTP等水解结构域，可以简单的测测酶活；不清楚你说的nucleotide binding什么意思
3，没有理解你的问题
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5楼2011-09-18 23:39:05
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wanhscn

木虫 (职业作家)
★ ★ ★
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nnsulei(金币+5): 谢谢帮助！ 2011-09-19 08:43:52
dhd997(金币+2): 继续鼓励 2011-09-19 14:25:16
1用软件分析，那是纸上谈兵，看起来像那么回事！
2有个物种上的这段序列是结合位点，那么你这个物种上也有这段序列，能不能说这就是本物种的结合位点呢？
可以，不过不能作为结论，可以作为讨论内容。
3两种实验方法分离核酸结合位点：
         1 DNA印迹法
         2 染色质免疫共沉淀 CHIP
  具体自己上网查查！
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6楼2011-09-19 08:22:26
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crazywangjin3楼
2011-09-15 09:37   回复  
nnsulei(金币+1): 2011-09-19 08:53:54
nnsulei7楼
2011-09-19 08:51   回复  
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