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nnsulei

金虫 (正式写手)

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[交流] 关于nucleotide binding（核酸结合位点）有谁知道？

本人获得一段氨基酸序列，是新物种的。想分析它的功能，不知道怎么找核酸结合位点nucleotide binding。谢谢。可以和其他物种比对查找吗？不知道是否保守呢，有个物种上的这段序列是结合位点，我这个物种上也有这段序列，能不能说这就是本物种的结合位点呢？或者什么软件分析？
谢谢！！！

[ Last edited by nnsulei on 2011-9-18 at 16:06 ]

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1楼 2011-09-15 08:34:06

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
dhd997(金币+3): good 2011-09-19 07:53:07
nnsulei(金币+1): 谢谢。这个酶在其他物种里有被研究过，能不能根据其他物种的研究来推断我的酶的功能位点。在其他物种里这个酶的氨基酸序列里有nucleotide binding位点的几个关键氨基酸，我想知道这个位点怎么找，是不是保守，另外它和nucleotide binding loop位点一样吗。谢谢！ 2011-09-19 08:38:49
nnsulei(金币+5): 谢谢帮助！再送5个！ 2011-09-19 08:39:22

1，你可以将你的序列进行初步的生物信息学分析，如果已经有相似序列被研究，则大致可以推知相关的功能；
2，如果是ATP/GTP等水解结构域，可以简单的测测酶活；不清楚你说的nucleotide binding什么意思
3，没有理解你的问题

赞一下(2人)

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5楼2011-09-18 23:39:05