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[交流] 蜥蜴全基因组测序完成

绿色变色龙蜥蜴是一种灵巧活泼的生物,这全凭其基因组所赐。蜥蜴全基因组测序使这种遗传性灵巧和其他新的线索浮现出来,并为人类、哺乳动物及相同进化级别爬虫类生物的基因组如何进化提供了见解,因为哺乳动物和爬虫生物是在3.2亿年前开始分化的。完成这项测序工程的研究人员8月31号在《 Nature》在线发表了他们的成果。

绿色变色龙蜥蜴(Anolis carolinensis)是第一种完成全基因组测序和组装的非鸟类爬行动物。研究人员组装并分析了超过20中哺乳动物的基因组,包括那些人类的进化史近亲,但是爬行动物的遗传图谱却一直未完成。

蜥蜴相比其他基因组已被测序的生物来说与同为爬行动物的鸟类更为接近。就像哺乳动物一样,鸟类和蜥蜴都是脊椎动物,这意味着他们都可以在水中产卵。“人们已经对脊椎动物进化树不同部分的动物进行了测序,但是之前还没有对蜥蜴进行取样研究,”《Nature》杂志的脊椎动物生物学科学主编Kerstin Lindblad-Toh说,“这是一个非常重要的分支。”

在加勒比海、北美、中美及南美分散着超过400种蜥蜴,这使得它们成为一种很好的研究进化的模式生物。尽管有关蜥蜴的生物学及行为学已经所知颇多,但是遗传学信息对于了解蜥蜴在进化中是如何分化十分重要。
最新测序的基因组可能帮忙解决在人类基因组织中与保守起源有关的非编码因子问题。这些区域不包含蛋白质编码基因,但是被认为具有非常重要的作用,因为它们在哺乳动物中一直都没有变化。科学家很好奇这些神秘 因子的来源,推测它们可能是残余的转座子。在人类中,很多这种叫做“跳跃基因”的基因已经失去了跳跃的能力,但是在蜥蜴中这种能力还保留着。

研究者将这些移动因子与人类基因组进行了对比,发现有将近100个人类基因组非编码基因是来自于这些跳跃基因。

研究人员首次分析了变色龙基因组中其他几种独特特征,包括微染色体,这是一种在爬行动物、两栖动物及鱼类中常发现的小染色体,但是从未出现在哺乳动物中。他们还发现了等容线的完全缺失,等容线是具有高浓度或低浓度鸟嘌呤或胸腺嘧啶的基因组区域,使人类染色体呈独特的带型。

此外,研究小组发现了蜥蜴的性染色体,这在以前的研究中只是一个猜想推测的对象。跟哺乳动物一样,绿色变色龙也有XX和XY染色体,这与鸟类不一样,雄性鸟类的性染色体为ZZ,雌性为ZW。蜥蜴的X性染色体是其众多微染色体中的一条。
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