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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 集群上输出的MS计算结果 哪个文件可以转化为优化好的结构？
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dgcrcat

金虫 (小有名气)

[求助] 集群上输出的MS计算结果 哪个文件可以转化为优化好的结构？

服务器上要求不能在节点上直接运行，只能通过LSF提交作业，用DMol3模块进行计算，将xsd文件转化为input文件，上传进行计算
输出的结果文件有很多，包括outmol文件以及其他在win下计算都能得到的文件
怎么将原来的xsd文件进行更新呢？

现在想到的办法是用analysis，选择structure，点击update
总是出现The document does not contain a valid trajectory
这是怎么回事？还是更新结构的方法不对？有解决方法吗？
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1楼 2011-09-07 17:33:54
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dgcrcat

金虫 (小有名气)
★
uuv2010(金币+1): 多谢提示 2011-09-26 13:06:29
uuv2010: 多谢分享 2011-09-26 13:06:50
将计算生成的文件连同输入文件全都下载到原先save files生成的文件夹内，然后打开xsd文件，用analysis，选择structure，点击update就可以使结构更新了
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3楼2011-09-26 11:45:56
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李佳佳佳

金虫 (正式写手)

Alice

引用回帖:
1楼: Originally posted by dgcrcat at 2011-09-07 17:33:54:
服务器上要求不能在节点上直接运行，只能通过LSF提交作业，用DMol3模块进行计算，将xsd文件转化为input文件，上传进行计算
输出的结果文件有很多，包括outmol文件以及其他在win下计算都能得到的文件
怎么将原来 ...

同问，期待高手~~
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停不下的马蹄，滴答滴答~
2楼2011-09-07 18:25:16
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