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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 材料区 » 晶体 » 晶体解析 » 关于是否存在氢键的问题
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matcher

铁杆木虫 (正式写手)

[求助] 关于是否存在氢键的问题

晶体解析后lst文件没有发现氢键列表，Platon检查也没有。但画出的堆积图却可以看到氢键的虚线，是分子间的氢键。请问这是怎么回事？该如何解决？
谢谢！
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1楼 2011-09-02 16:01:07
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lyl163com

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
lichun1210(金币+1): 欢迎常来晶体版交流！ 2011-09-02 16:26:28
matcher(金币+5): 非常感谢！ 2011-09-03 20:38:28
引用回帖:
1楼: Originally posted by matcher at 2011-09-02 16:01:07:
晶体解析后lst文件没有发现氢键列表，Platon检查也没有。但画出的堆积图却可以看到氢键的虚线，是分子间的氢键。请问这是怎么回事？该如何解决？
谢谢！

量一下距离看是否有氢键，在精修是你加HTAB命令了吗？
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2楼2011-09-02 16:05:15
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matcher

铁杆木虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by lyl163com at 2011-09-02 16:05:15:
量一下距离看是否有氢键，在精修是你加HTAB命令了吗？

我量量看，精修的时候加了HTAB指令了。
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3楼2011-09-02 16:10:08
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matcher

铁杆木虫 (正式写手)
量了下，自动生成的氢键键长分别为2.8和2.9 键角是88度，是H-O-H键。这个是不是氢键呢？
如果不是，如何在堆积图中取消虚线？
如果是，如何在CIF中加上氢键列表？
非常感谢！
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4楼2011-09-02 16:21:07
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lyl163com

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
4楼: Originally posted by matcher at 2011-09-02 16:21:07:
量了下，自动生成的氢键键长分别为2.8和2.9 键角是88度，是H-O-H键。这个是不是氢键呢？
如果不是，如何在堆积图中取消虚线？
如果是，如何在CIF中加上氢键列表？
非常感谢！

是氢键，在ins文件中加htab精修即可，完了在lst文件的靠后的位置可以找到氢键列表。
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5楼2011-09-02 17:06:22
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matcher

铁杆木虫 (正式写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by lyl163com at 2011-09-02 17:06:22:
是氢键，在ins文件中加htab精修即可，完了在lst文件的靠后的位置可以找到氢键列表。

可是在ins文件里已经加了HTAB了啊，lst中确实没有氢键列表。
很奇怪的问题！
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6楼2011-09-02 17:36:31
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jinjinyang

金虫 (正式写手)
键角太小，可能不是
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7楼2011-10-12 15:17:15
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yytsnake

至尊木虫 (职业作家)
也许O上的加H不是太.....。
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8楼2011-10-12 20:43:47
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