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rollandyoung

金虫 (小有名气)

[求助] NCBI中blastn只能用默认的人类基因组作为筛选的数据库,不能选择其他的,求解!

问题描述:
如图,在选择搜索的数据库时只能选择“human genomic +transcript”,如果选择其他项,例如“others”则选项背景显示为黄色,下面对此做出了解释,英文翻译过来大意为“与默认参数不同的参数值用黄色显示并用◇进行标记”。
目的:
我用来搜索的序列为皱木耳gpd基因上游2000bp序列,我想通过同源序列搜索验证一下此序列是否包含gpd基因的启动子序列,但是在blast的时候就出现了上面所描述的问题。
请大家不吝赐教,多谢!
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hf2016

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

rollandyoung(金币+5): 嗯,你这么一说我明白了,十分感谢! 2011-09-02 12:26:33
在下认为只是提示你用的不是默认的参数,不会影响你的blast功能的
一切开始于结束之后
2楼2011-09-02 08:40:27
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瓶儿花

金虫 (小有名气)

嗯嗯,楼上说的很对!
3楼2011-09-02 15:11:53
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