应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 有关DS的问题
81/1返回列表
查看: 1132  |  回复: 7
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

liuxiu841027

金虫 (正式写手)

[交流] 有关DS的问题

想请教一个问题：我用DS的libdock对接筛选了一个化合物库，结果出来很多分子，怎么样把这些化合物分子导出来到Chemdraw成2D结构呢？谢谢！
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

Discovery Studio 常见问题及使用教程

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

» 抢金币啦！回帖就可以得到:

查看全部散金贴
1楼 2011-08-31 15:07:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ts2009

木虫 (著名写手)
★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
御剑江湖(金币+3): 谢谢 2011-08-31 22:39:59
liuxiu841027(金币+1): 谢谢 2011-09-01 11:48:02
可以用某些软件把这些分子转换成2D的，没必要在chemdraw中弄。只要分子的格式是一些呢常见的格式如sdf 之类的。
赞一下(2人) 回复此楼
2楼2011-08-31 20:54:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liuxiu841027

金虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by ts2009 at 2011-08-31 20:54:55:
可以用某些软件把这些分子转换成2D的，没必要在chemdraw中弄。只要分子的格式是一些呢常见的格式如sdf 之类的。

转成2D的能很清楚的像chemdraw看到的结果一样吗？有想能清楚地看到结构，就像chemdraw画图显示的结果一样呢，可以复制到word或ppt中的
赞一下 回复此楼
3楼2011-09-01 11:50:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ts2009

木虫 (著名写手)
★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
ghcacj(金币+3): 谢谢 2011-09-01 15:34:17
我刚才找了下，用软件转成的2D结构不能保存成png,tif或是jpg格式的图像文件。所以个人觉得可以用软件转换成2D结构后，用chemica draw 重新画，这样能保证分辨率，对于发paper很重要。提醒的是必须先转换成2D结构，不然由于3D图像分子中的手性以及二面角的影响，是无法直观的用3D图像画出2D的图像的。祝好运。。。
赞一下(2人) 回复此楼
4楼2011-09-01 13:14:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liuxiu841027

金虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by ts2009 at 2011-09-01 13:14:54:
我刚才找了下，用软件转成的2D结构不能保存成png,tif或是jpg格式的图像文件。所以个人觉得可以用软件转换成2D结构后，用chemica draw 重新画，这样能保证分辨率，对于发paper很重要。提醒的是必须先转换成2D结构， ...

恩，谢谢！我用DS保存成mol2格式，再在chem3D打开可以用chemdraw显示2D结构。但是只能一个一个的，太慢了，想快点，多个或批量的导出
赞一下 回复此楼
5楼2011-09-01 15:24:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ts2009

木虫 (著名写手)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
ghcacj(金币+2): 谢谢 2011-09-02 15:23:55
引用回帖:
5楼: Originally posted by liuxiu841027 at 2011-09-01 15:24:05:
恩，谢谢！我用DS保存成mol2格式，再在chem3D打开可以用chemdraw显示2D结构。但是只能一个一个的，太慢了，想快点，多个或批量的导出

恩，没办法的，分子数很多的情况下只能一个一个的画，之前我也没找到什么批量生成的工具。呵呵。
赞一下(2人) 回复此楼
6楼2011-09-01 15:59:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chemozhang

木虫 (正式写手)
帖子真精彩!
已经收录到淘贴专辑《Discovery Studio 常见问题及使用教程》
赞一下 回复此楼
7楼2011-09-05 18:31:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
简单回复
mingzezhong8楼
2011-10-17 14:17   回复  
相关版块跳转 我要订阅楼主 liuxiu841027 的主题更新
81/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 一志愿北京化工大学070300 学硕336求调剂 +4 vv迷 2026-03-21 7/350 2026-03-22 12:02 by vv迷
[考研] 环境学硕288求调剂 +4 皮皮皮123456 2026-03-22 4/200 2026-03-22 11:07 by 杨杨杨紫
[考研] 08工科 320总分 求调剂 +7 梨花珞晚风 2026-03-17 7/350 2026-03-22 10:03 by 2026paper
[考研] 化学调剂 +5 yzysaa 2026-03-21 5/250 2026-03-21 22:12 by peike
[考研] 求调剂 +4 要好好无聊 2026-03-21 4/200 2026-03-21 18:57 by 学员8dgXkO
[考研] 工科0856求调剂 +3 沐析汀汀 2026-03-21 3/150 2026-03-21 18:30 by 学员8dgXkO
[考研] 297求调剂 +11 戏精丹丹丹 2026-03-17 12/600 2026-03-21 17:47 by ColorlessPI
[基金申请] 学校已经提交到NSFC，还能修改吗？ 40+4 babangida 2026-03-19 9/450 2026-03-21 16:12 by babangida
[考研] 22 350 本科985求调剂，求老登收留 +3 李轶男003 2026-03-20 3/150 2026-03-21 13:28 by 搏击518
[考研] 307求调剂 +3 wyyyqx 2026-03-17 3/150 2026-03-21 03:20 by JourneyLucky
[考研] 一志愿华中科技大学，080502，354分求调剂 +5 守候夕阳CF 2026-03-18 5/250 2026-03-21 01:06 by JourneyLucky
[考研] 一志愿武理材料305分求调剂 +6 想上岸的鲤鱼 2026-03-18 7/350 2026-03-21 01:03 by JourneyLucky
[考研] 南京大学化学376求调剂 +3 hisfailed 2026-03-19 6/300 2026-03-20 23:43 by hisfailed
[考研] 323求调剂 +3 洼小桶 2026-03-18 3/150 2026-03-20 22:54 by JourneyLucky
[考研] 261求B区调剂，科研经历丰富 +3 牛奶很忙 2026-03-20 4/200 2026-03-20 19:34 by JourneyLucky
[考研] 求调剂 +3 eation27 2026-03-20 3/150 2026-03-20 19:32 by JourneyLucky
[考研] 一志愿南理工085701环境302求调剂院校 +3 葵梓卫队 2026-03-20 3/150 2026-03-20 19:28 by zhukairuo
[考研] 广西大学家禽遗传育种课题组2026年硕士招生（接收计算机专业调剂） +3 123阿标 2026-03-17 3/150 2026-03-20 15:58 by 飞行琦
[论文投稿] 申请回稿延期一个月，编辑同意了。但系统上的时间没变，给编辑又写邮件了，没回复 10+3 wangf9518 2026-03-17 4/200 2026-03-19 23:55 by babero
[考研] 0856求调剂 +3 刘梦微 2026-03-15 3/150 2026-03-16 10:00 by houyaoxu
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭