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liuxiu841027

金虫 (正式写手)


[交流] 有关DS的问题

想请教一个问题:我用DS的libdock对接筛选了一个化合物库,结果出来很多分子,怎么样把这些化合物分子导出来到Chemdraw成2D结构呢?谢谢!
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ts2009

木虫 (著名写手)


★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
御剑江湖(金币+3): 谢谢 2011-08-31 22:39:59
liuxiu841027(金币+1): 谢谢 2011-09-01 11:48:02
可以用某些软件把这些分子转换成2D的,没必要在chemdraw中弄。只要分子的格式是一些呢常见的格式如sdf 之类的。
2楼2011-08-31 20:54:55
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liuxiu841027

金虫 (正式写手)


引用回帖:
2楼: Originally posted by ts2009 at 2011-08-31 20:54:55:
可以用某些软件把这些分子转换成2D的,没必要在chemdraw中弄。只要分子的格式是一些呢常见的格式如sdf 之类的。

转成2D的能很清楚的像chemdraw看到的结果一样吗?有想能清楚地看到结构,就像chemdraw画图显示的结果一样呢,可以复制到word或ppt中的
3楼2011-09-01 11:50:07
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ts2009

木虫 (著名写手)


★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
ghcacj(金币+3): 谢谢 2011-09-01 15:34:17
我刚才找了下,用软件转成的2D结构不能保存成png,tif或是jpg格式的图像文件。所以个人觉得可以用软件转换成2D结构后,用chemica draw 重新画,这样能保证分辨率,对于发paper很重要。提醒的是必须先转换成2D结构,不然由于3D图像分子中的手性以及二面角的影响,是无法直观的用3D图像画出2D的图像的。祝好运。。。
4楼2011-09-01 13:14:54
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liuxiu841027

金虫 (正式写手)


引用回帖:
4楼: Originally posted by ts2009 at 2011-09-01 13:14:54:
我刚才找了下,用软件转成的2D结构不能保存成png,tif或是jpg格式的图像文件。所以个人觉得可以用软件转换成2D结构后,用chemica draw 重新画,这样能保证分辨率,对于发paper很重要。提醒的是必须先转换成2D结构, ...

恩,谢谢!我用DS保存成mol2格式,再在chem3D打开可以用chemdraw显示2D结构。但是只能一个一个的,太慢了,想快点,多个或批量的导出
5楼2011-09-01 15:24:05
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ts2009

木虫 (著名写手)


★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
ghcacj(金币+2): 谢谢 2011-09-02 15:23:55
引用回帖:
5楼: Originally posted by liuxiu841027 at 2011-09-01 15:24:05:
恩,谢谢!我用DS保存成mol2格式,再在chem3D打开可以用chemdraw显示2D结构。但是只能一个一个的,太慢了,想快点,多个或批量的导出

恩,没办法的,分子数很多的情况下只能一个一个的画,之前我也没找到什么批量生成的工具。呵呵。
6楼2011-09-01 15:59:51
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chemozhang

木虫 (正式写手)


帖子真精彩!
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7楼2011-09-05 18:31:24
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简单回复
2011-10-17 14:17   回复  
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