应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 有关DS的问题
81/1返回列表
查看: 1073  |  回复: 7
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

liuxiu841027

金虫 (正式写手)

[交流] 有关DS的问题

想请教一个问题：我用DS的libdock对接筛选了一个化合物库，结果出来很多分子，怎么样把这些化合物分子导出来到Chemdraw成2D结构呢？谢谢！
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

Discovery Studio 常见问题及使用教程

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

» 抢金币啦！回帖就可以得到:

查看全部散金贴
1楼 2011-08-31 15:07:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ts2009

木虫 (著名写手)
★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
御剑江湖(金币+3): 谢谢 2011-08-31 22:39:59
liuxiu841027(金币+1): 谢谢 2011-09-01 11:48:02
可以用某些软件把这些分子转换成2D的，没必要在chemdraw中弄。只要分子的格式是一些呢常见的格式如sdf 之类的。
赞一下(2人) 回复此楼
2楼2011-08-31 20:54:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liuxiu841027

金虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by ts2009 at 2011-08-31 20:54:55:
可以用某些软件把这些分子转换成2D的，没必要在chemdraw中弄。只要分子的格式是一些呢常见的格式如sdf 之类的。

转成2D的能很清楚的像chemdraw看到的结果一样吗？有想能清楚地看到结构，就像chemdraw画图显示的结果一样呢，可以复制到word或ppt中的
赞一下 回复此楼
3楼2011-09-01 11:50:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ts2009

木虫 (著名写手)
★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
ghcacj(金币+3): 谢谢 2011-09-01 15:34:17
我刚才找了下，用软件转成的2D结构不能保存成png,tif或是jpg格式的图像文件。所以个人觉得可以用软件转换成2D结构后，用chemica draw 重新画，这样能保证分辨率，对于发paper很重要。提醒的是必须先转换成2D结构，不然由于3D图像分子中的手性以及二面角的影响，是无法直观的用3D图像画出2D的图像的。祝好运。。。
赞一下(2人) 回复此楼
4楼2011-09-01 13:14:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liuxiu841027

金虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by ts2009 at 2011-09-01 13:14:54:
我刚才找了下，用软件转成的2D结构不能保存成png,tif或是jpg格式的图像文件。所以个人觉得可以用软件转换成2D结构后，用chemica draw 重新画，这样能保证分辨率，对于发paper很重要。提醒的是必须先转换成2D结构， ...

恩，谢谢！我用DS保存成mol2格式，再在chem3D打开可以用chemdraw显示2D结构。但是只能一个一个的，太慢了，想快点，多个或批量的导出
赞一下 回复此楼
5楼2011-09-01 15:24:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ts2009

木虫 (著名写手)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
ghcacj(金币+2): 谢谢 2011-09-02 15:23:55
引用回帖:
5楼: Originally posted by liuxiu841027 at 2011-09-01 15:24:05:
恩，谢谢！我用DS保存成mol2格式，再在chem3D打开可以用chemdraw显示2D结构。但是只能一个一个的，太慢了，想快点，多个或批量的导出

恩，没办法的，分子数很多的情况下只能一个一个的画，之前我也没找到什么批量生成的工具。呵呵。
赞一下(2人) 回复此楼
6楼2011-09-01 15:59:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chemozhang

木虫 (正式写手)
帖子真精彩!
已经收录到淘贴专辑《Discovery Studio 常见问题及使用教程》
赞一下 回复此楼
7楼2011-09-05 18:31:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
简单回复
mingzezhong8楼
2011-10-17 14:17   回复  
相关版块跳转 我要订阅楼主 liuxiu841027 的主题更新
81/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭