| 查看: 3706 | 回复: 12 | ||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | ||
mailchensu铁虫 (小有名气)
|
[求助]
细菌鉴定--blast后一定要再到Genbank中检索才能确定什么菌，得到accession number吗？
|
|
| 筛出的细菌进行16s rDNA 测序后，进行了blast比对后，该菌的query coverage 和 Max identity与检索到的一个菌都是100%，这样可以推断就是检索到的那个菌吗（可以用blast里的accession number 作为我筛到菌的号码不）？还是不管blast检索到什么结果，都必须到Genbank检索一下呢，才能得到我筛到菌的accession number 。不管它是已发现的菌还是新菌也好，我的目的是想得到我筛的菌的accession number ，因为发表文章的时候会要用到这个号码。我不是作为生物方面的，请这方面的专家帮我指导一下吧，谢谢！ |
回复此楼» 猜你喜欢
281求调剂（0805）
已经有8人回复
-
环境领域全国重点实验室招收博士1-2名
已经有3人回复
-
材料专硕306英一数二
已经有10人回复
-
301求调剂
已经有6人回复
-
一志愿天津大学化学工艺专业（081702）315分求调剂
已经有7人回复
-
302求调剂
已经有6人回复
-
26博士申请
已经有3人回复
-
268求调剂
已经有3人回复
-
311求调剂
已经有10人回复
-
被我言中：新模板不强调格式了，假专家开始管格式了
已经有4人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- Web of science 检索要滞后些吗?
已经有18人回复
- 急急急……求助，拿到两个offer，想确定好了老板再拒另一个学校。可行吗？
已经有12人回复
- 希望可以得到大家的帮助，一位珍爱生物的学生的求助
已经有84人回复
- 怎么让自己的寒体质得到改善
已经有8人回复
- 菌落平板计数 菌落数差别大
已经有18人回复
- 做细菌最适ph的液体培养基用什么？
已经有15人回复
- 如何玩转百度文库，使之不在成为你没有BB的烦恼
已经有417人回复
- 怎么知道新入库的杂志
已经有4人回复
- SCI论文录用未发表，怎样证明其会被SCI检索【填表急用】，谢谢
已经有22人回复
- 怎么才能知道要查的文章在哪个数据库收录
已经有12人回复
- 寻求把细菌的16s rDNA序列提交到Genbank，申请accession number 的专家-谢谢！
已经有3人回复
- 向genbank提交序列之后，收到一信件，需要提供有关样品的信息？有人遇到过么？救赎
已经有19人回复
- 我向Genbank提交了序列并收到了登录号，可我把那封邮件弄没了，怎么再获得登录号？
已经有12人回复
- 【求助/交流】关于genbank里细菌命名的问题
已经有4人回复
koala2007
木虫 (正式写手)
- 应助: 6 (幼儿园)
- 金币: 2175.4
- 散金: 1
- 帖子: 576
- 在线: 233.4小时
- 虫号: 249388
- 注册: 2006-05-06
- 性别: GG
- 专业: 环境微生物学
8楼2015-05-02 22:46:24
2楼2011-08-31 14:16:41
天鸟
木虫 (正式写手)
- MicEPI: 1
- 应助: 12 (小学生)
- 金币: 2548.5
- 散金: 52
- 红花: 7
- 帖子: 515
- 在线: 186.4小时
- 虫号: 627037
- 注册: 2008-10-15
- 性别: GG
- 专业: 环境微生物学
3楼2011-08-31 20:06:57
★ ★ ★
scelab(金币+3): 鼓励新虫，谢谢交流哦~ 2011-08-31 23:29:27
scelab(金币+3): 鼓励新虫，谢谢交流哦~ 2011-08-31 23:29:27
|
筛出的细菌进行16s rDNA 测序后，进行了blast比对后，该菌的query coverage 和 Max identity与检索到的一个菌都是100%，这样可以推断就是检索到的那个菌吗？ 答：不一定，NCBI有点像论坛的BBS，谁都可以提交序列。你最好还应该跟模式菌株的参考序列进行比对，模式菌株的序列详见网站，http://www.bacterio.cict.fr/。 另，就是100%相似，也不能完确认就一定是同一个种，因为16S 是非常保守的，部分种之间的16S 相似度高达100%. |
4楼2011-08-31 21:41:59
