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mailchensu

铁虫 (小有名气)

[求助] 细菌鉴定--blast后一定要再到Genbank中检索才能确定什么菌,得到accession number吗?

筛出的细菌进行16s rDNA 测序后,进行了blast比对后,该菌的query coverage 和 Max identity与检索到的一个菌都是100%,这样可以推断就是检索到的那个菌吗(可以用blast里的accession number 作为我筛到菌的号码不)?还是不管blast检索到什么结果,都必须到Genbank检索一下呢,才能得到我筛到菌的accession number 。不管它是已发现的菌还是新菌也好,我的目的是想得到我筛的菌的accession number ,因为发表文章的时候会要用到这个号码。我不是作为生物方面的,请这方面的专家帮我指导一下吧,谢谢!
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sx14

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by ququtdr at 2011-08-31 21:41:59
筛出的细菌进行16s rDNA 测序后,进行了blast比对后,该菌的query coverage 和 Max identity与检索到的一个菌都是100%,这样可以推断就是检索到的那个菌吗?

答:不一定,NCBI有点像论坛的BBS,谁都可以提交序列 ...

如何用该网站啊
13楼2018-07-27 15:38:23
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