24小时热门版块排行榜    

查看: 4936  |  回复: 16
本帖产生 1 个 MolEPI ,点击这里进行查看
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

飞翔的诗人

银虫 (小有名气)

[求助] 1.5kb的 PCR目的序列GC含量高达67%,引物Tm值达90℃,怎么P比较好?

本人根据目的序列的CDS区设计出引物,由于目的序列本身GC含量达67%,设计出的引物GC含量也超过了60%,oligo给出的两条引物的Tm值均在90℃左右,其推荐的退火温度为68.4℃(最高72度),
上游 5'-tcGAATTCatgtcccagc ccgacgccac cccgtt-3' (EcoR I酶切位点)
下游 5'-tctAAGCTTtcaggctccg gcccggttga ggacg-3'(Hind III酶切位点)
oligo最后给引物的PCR评价没问题,不过这么高的GC含量,该怎么P比较好?如果是用带GC缓冲液的Taq酶,梯度PCR反应条件该如何设计?
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

空谷幽风

金虫 (正式写手)

引用回帖:
8楼: Originally posted by litianfeng at 2011-08-29 16:11:10:
我要的片段GC含量也很高,扩了好几次都扩不出来,总是出现好多其他的条带,加入DMSO可以吗?

如果GC含量比较高,建议你加DMSO
a?,c??ae~?a,EURc§?c?μé-,cs,,a‘?é?“i1/4?i1/4?i1/4?i1/4?
11楼2011-08-29 18:57:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 17 个回答

空谷幽风

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
飞翔的诗人(金币+10): 5 2011-08-29 14:49:28
西瓜(金币+3): Good 2011-08-29 17:50:35
1.建议你把保护碱基的数量增加到4-5个
2.你说的GC缓冲液我没用过,不过你可以在扩增体系中加入DMSO,扩增程序可以这么设置看看行不行:
96℃  5min
96℃  30s
63℃  20s
72℃  2min
设置30个循环,每个循环降0.2
a?,c??ae~?a,EURc§?c?μé-,cs,,a‘?é?“i1/4?i1/4?i1/4?i1/4?
2楼2011-08-29 13:19:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

飞翔的诗人

银虫 (小有名气)

谢谢你的回复,有几个问题再问下,首先是为什么要加上4-5个保护碱基,还有加入DMSO起了什么作用,每个循环降0.2是指退火温度降0.2度吗?
3楼2011-08-29 14:56:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

blackrose8089

铁杆木虫 (职业作家)

呵呵,我们做的物种GC含量平均还在66%左右!
jiayoubashaonian
4楼2011-08-29 14:58:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 今天系统多次维护,明天很可能放榜! +5 zju2000 2026-08-16 5/250 2026-08-16 23:23 by Haru815
[基金申请] 欢迎发来filecode的Mz6后的代码验证其规律 +32 医学老男孩 2026-08-13 74/3700 2026-08-16 21:05 by 医学老男孩
[基金申请] 时间戳又变了8-15 +13 archvillain 2026-08-15 25/1250 2026-08-16 20:13 by zhaosm1982
[基金申请] 2027广东省杰青 +3 奶牛小黑 2026-08-15 6/300 2026-08-16 20:07 by 奶牛小黑
[基金申请] 快农历七夕节了,轻松一下,男人悄悄话,女施主请不要进来。 +3 Tide man 2026-08-14 3/150 2026-08-16 17:47 by jurkat.1640
[基金申请] 咱们一起用铁证分析2026国家社科基金中标与否 +7 启萌科技 2026-08-12 26/1300 2026-08-16 12:35 by 启萌科技
[基金申请] 我的国基提前知道中了,可是同事的操作让我实在接受不了,怎么会有这样的人 +11 家与远方 2026-08-10 16/800 2026-08-16 10:28 by ray43
[基金申请] 有时候,自然基金真的不能太认真 (我的申报经验) +10 majunge000 2026-08-11 12/600 2026-08-16 08:18 by xli1984
[基金申请] filecode +8 cratir 2026-08-14 12/600 2026-08-15 18:08 by zyfgau
[基金申请] 小木虫上这么多卖论文的,真有人买论文么?感觉没必要啊 +12 Tide man 2026-08-10 13/650 2026-08-15 16:34 by 氺木
[基金申请] 奇怪,两个人的filecode固定段从头到尾一模一样 +8 布布和一二 2026-08-10 11/550 2026-08-14 14:58 by Equinoxhua
[硕博家园] 读博的好处 +4 lnee 2026-08-11 4/200 2026-08-14 10:20 by ahsoarli
[基金申请] 重要来源:本周末出结果 +10 瞬息宇宙 2026-08-12 10/500 2026-08-13 15:46 by likettle
[基金申请] 不应该看fileCode +7 且听虎啸 2026-08-12 9/450 2026-08-13 14:27 by flydreamws
[基金申请] Filecode 又变了,巨变 +3 WH3796 2026-08-12 4/200 2026-08-13 14:13 by 小木虫6752397
[基金申请] 分享一下我之前已中青C的计划书的filecode +4 布布和一二 2026-08-11 5/250 2026-08-13 12:56 by cratir
[基金申请] 为什么网上很多人说本周 12号出结果 +6 瞬息宇宙 2026-08-10 7/350 2026-08-11 19:25 by Tide man
[基金申请] 确定了,国自然21号放榜 +6 布布和一二 2026-08-10 7/350 2026-08-10 19:15 by 2000zf36392
[基金申请] 国自然结果 +4 Vierhys 2026-08-10 8/400 2026-08-10 15:06 by Vierhys
[基金申请] 据悉今年马上要出结果了 +7 瞬息宇宙 2026-08-10 8/400 2026-08-10 12:42 by Vivilian
信息提示
请填处理意见