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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 材料区 » 晶体 » CIF专栏 » 求助cifA类及B类错误
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liuyonghua84

银虫 (小有名气)

[求助] 求助cifA类及B类错误

Alert level A
DIFMN02_ALERT_2_A  The minimum difference density is < -0.1*ZMAX*2.00
            _refine_diff_density_min given =     -5.460
            Test value =     -5.400
REFLT03_ALERT_3_A  Reflection count < 85% complete (theta max?)
           From the CIF: _diffrn_reflns_theta_max           29.07
           From the CIF: _diffrn_reflns_theta_full          29.07
           From the CIF: _reflns_number_total               4403
           TEST2: Reflns within _diffrn_reflns_theta_max
           Count of symmetry unique reflns         5261
           Completeness (_total/calc)             83.69%
SHFSU01_ALERT_2_A  The absolute value of parameter shift to su ratio > 0.20
            Absolute value of the parameter shift to su ratio given   1.506
            Additional refinement cycles may be required.
PLAT029_ALERT_3_A _diffrn_measured_fraction_theta_full Low .......      0.837      
PLAT080_ALERT_2_A Maximum Shift/Error ............................       1.51      
PLAT098_ALERT_2_A Large Reported Min.  (Negative) Residual Density      -5.46 eA-3
PLAT211_ALERT_2_A ADP of Atom O10     is N.P.D. or (nearly) 2D ...          ?     
PLAT211_ALERT_2_A ADP of Atom O13     is N.P.D. or (nearly) 2D ...          ?     
PLAT211_ALERT_2_A ADP of Atom O18     is N.P.D. or (nearly) 2D ...          ?     
PLAT211_ALERT_2_A ADP of Atom C6      is N.P.D. or (nearly) 2D ...          ?     
PLAT211_ALERT_2_A ADP of Atom C7      is N.P.D. or (nearly) 2D ...          ?     
PLAT211_ALERT_2_A ADP of Atom C8      is N.P.D. or (nearly) 2D ...          ?     
PLAT211_ALERT_2_A ADP of Atom C9      is N.P.D. or (nearly) 2D ...          ?     
PLAT211_ALERT_2_A ADP of Atom C10     is N.P.D. or (nearly) 2D ...          ?     
PLAT211_ALERT_2_A ADP of Atom Co1     is N.P.D. or (nearly) 2D ...          ?     
PLAT211_ALERT_2_A ADP of Atom O3      is N.P.D. or (nearly) 2D ...          ?     
PLAT211_ALERT_2_A ADP of Atom O6      is N.P.D. or (nearly) 2D ...          ?     
PLAT211_ALERT_2_A ADP of Atom O7      is N.P.D. or (nearly) 2D ...          ?     
PLAT211_ALERT_2_A ADP of Atom C1      is N.P.D. or (nearly) 2D ...          ?     
PLAT211_ALERT_2_A ADP of Atom C2      is N.P.D. or (nearly) 2D ...          ?     
PLAT211_ALERT_2_A ADP of Atom C3      is N.P.D. or (nearly) 2D ...          ?     
PLAT213_ALERT_2_A Atom O16             has ADP max/min Ratio .....       17.8 prola
PLAT213_ALERT_2_A Atom O17             has ADP max/min Ratio .....        6.4 prola
PLAT417_ALERT_2_A Short Inter D-H..H-D       H13A   ..  H19A    ..       1.68 Ang.
PLAT417_ALERT_2_A Short Inter D-H..H-D       H13A   ..  H19A    ..       1.56 Ang.
Alert level B
DIFMX01_ALERT_2_B  The maximum difference density is > 0.1*ZMAX*1.00
            _refine_diff_density_max given =      4.382
            Test value =      2.700
RFACR01_ALERT_3_B  The value of the weighted R factor is > 0.35
            Weighted R factor given   0.405
PLAT084_ALERT_2_B High wR2 Value .................................       0.40      
PLAT097_ALERT_2_B Large Reported Max.  (Positive) Residual Density       4.38 eA-3
PLAT213_ALERT_2_B Atom O15             has ADP max/min Ratio .....        4.5 prola
PLAT213_ALERT_2_B Atom C4              has ADP max/min Ratio .....        4.7 oblat
PLAT250_ALERT_2_B Large U3/U1 Ratio for Average U(i,j) Tensor ....        6.2      
PLAT250_ALERT_2_B Large U3/U1 Ratio for Average U(i,j) Tensor ....        6.5      
PLAT417_ALERT_2_B Short Inter D-H..H-D       H1B    ..  H11A    ..       1.85 Ang.
PLAT417_ALERT_2_B Short Inter D-H..H-D       H4A    ..  H14A    ..       1.99 Ang.
PLAT417_ALERT_2_B Short Inter D-H..H-D       H4B    ..  H14B    ..       1.99 Ang.
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liuyonghua84 liuyonghua84

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1楼 2011-08-22 21:44:53
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lyl163com

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
1楼: Originally posted by liuyonghua84 at 2011-08-22 21:44:53:
Alert level A
DIFMN02_ALERT_2_A  The minimum difference density is < -0.1*ZMAX*2.00
            _refine_diff_density_min given =     -5.460
            Test value =     -5.400
REFLT03_ALERT_ ...

错误这么多，是不是空间群有问题呢？
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2楼2011-08-22 21:49:05
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liuyonghua84

银虫 (小有名气)
我也是觉得错误太多，实在没办法解决 ，你说的也可能，可是我用别的空间群的话 分子式都不对呢 怎么回事，麻烦了
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3楼2011-08-22 21:55:37
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liuyonghua84

银虫 (小有名气)
送鲜花一朵
那我用别的空间群解一遍，图是不是我都得重新话呢
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4楼2011-08-22 21:58:55
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liuyonghua84

银虫 (小有名气)
送鲜花一朵
感谢
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5楼2011-08-23 17:54:22
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xi2004

至尊木虫 (职业作家)
恐怕主要是数据本身不好。
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xi2004-emuch@163.com
6楼2011-08-24 08:41:05
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cf_success

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
lichun1210(金币+2): 欢迎常来晶体版交流 2011-09-02 22:54:40
liuyonghua84(金币+10): 2011-09-06 22:17:27
前四个错误填好ins文件，z值，size填写……
PLAT080_ALERT_2_A Maximum Shift/Error  增加精修轮数
211 213错误用各项同性isor限定，或者simu delu
250错误可能有原子非正定
417错误用dfix限定H原子间距。应该是游离O上的H吧，不行就重新加H，避免游离O互为受体原子

错误比较多，211 213错误也可能是晶体本身数据导致，考虑重新采集数据
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7楼2011-09-02 20:03:58
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