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666cdd

铜虫 (初入文坛)

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[求助] 钙长石的原子坐标

各位大侠，本人刚接触MS5.0软件，想画钙长石的晶体模型，遇到了原子坐标的问题，求解？

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1楼 2011-08-21 20:35:41

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gyliu

铁杆木虫 (职业作家)

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【答案】应助回帖

666cdd(金币+6): 谢谢 2011-08-22 13:40:02

*data for ICSD #86319
Coll Code 86319
Rec  Date 1999/11/30
Mod  Date 2003/04/01
Chem Name Calcium Tecto-dialumodisilicate
Structured  Ca (Al2 Si2 O8)
Sum       Al2 Ca1 O8 Si2
ANX       AB2C2X8
Min Name Anorthite
D(calc)    2.76
Title    Structural variation associated with compositional variation and
         order-disorder behavior in anorthite-rich feldspars
Author(s) Angel, R.J.;Carpenter, M.A.;Finger, L.W.
Reference American Mineralogist
         (1990), 75, 150-162
Unit Cell 8.178(2) 12.870(3) 14.175(3) 93.17(2) 115.97(1) 91.15(2)
Vol       1337.6
Z          8
Space Group P -1
SG Number 2
Cryst Sys triclinic
Pearson    aP104
Wyckoff    i52
R Value    .064
Red Cell P  8.178 12.87 12.895 85.784 81.209 88.849 1337.598
Trans Red -1.000 0.000 0.000 / 0.000 1.000 0.000 / -1.000 0.000 -1.000
Comments z(Si4) was misprinted as .6202, center of O4-O16-O24-O32 in
         .5067 .3226 .1085
         Mean Si-O= 1.617, Al-O= 1.742
         Compound with mineral name: Anorthite
         The structure has been assigned a PDF number (calculated
         powder diffraction data): 01-089-1461
         The structure has been assigned a PDF number (experimental
         powder diffraction data): 41-1486
         Structure type : CaAl2Si2O8
         X-ray diffraction from single crystal
         The coordinates given in the paper contain an error. The
         values in the database have been corrected.
Atom  # OX SITE    x          y          z          SOF    H
Ca 1  +2 2 i 0.2655(3) 0.9871(2) 0.0856(2)    1.       0
Ca 2  +2 2 i 0.2681(2) 0.0301(1) 0.5445(1)    1.       0
Ca 3  +2 2 i 0.7735(3) 0.5344(2) 0.5431(1)    1.       0
Ca 4  +2 2 i 0.7654(3) 0.5135(2) 0.0660(2)    1.       0
Si 1  +4 2 i 0.0089(3) 0.1590(2) 0.1042(2)    1.       0
Si 2  +4 2 i 0.5068(3) 0.6569(2) 0.6044(2)    1.       0
Al 1  +3 2 i 0.0053(3) 0.1626(2) 0.6113(2)    1.       0
Al 2  +3 2 i 0.4996(3) 0.6658(2) 0.1124(2)    1.       0
Al 3  +3 2 i 0.9938(3) 0.8154(2) 0.1185(2)    1.       0
Al 4  +3 2 i 0.5061(3) 0.3147(2) 0.6202(2)    1.       0
Si 3  +4 2 i 0.0057(3) 0.8162(2) 0.6135(2)    1.       0
Si 4  +4 2 i 0.5061(3) 0.3197(2) 0.1102(2)    1.       0
Al 5  +3 2 i 0.6855(3) 0.1130(2) 0.1530(2)    1.       0
Al 6  +3 2 i 0.1906(3) 0.6112(2) 0.6647(2)    1.       0
Si 5  +4 2 i 0.6797(3) 0.1046(2) 0.6631(2)    1.       0
Si 6  +4 2 i 0.1733(3) 0.6062(2) 0.1523(2)    1.       0
Si 7  +4 2 i 0.6752(3) 0.8829(2) 0.1864(2)    1.       0
Si 8  +4 2 i 0.1766(3) 0.3800(2) 0.6759(2)    1.       0
Al 7  +3 2 i 0.6814(3) 0.8735(2) 0.6738(2)    1.       0
Al 8  +3 2 i 0.1849(4) 0.3761(2) 0.1798(2)    1.       0
O 1  -2 2 i 0.0222(8) 0.1252(5) -.0047(4)    1.       0
O 2  -2 2 i 0.4939(8) 0.6243(5) 0.4881(4)    1.       0
O 3  -2 2 i 0.9822(8) 0.1255(4) 0.4838(4)    1.       0
O 4  -2 2 i 0.5115(8) 0.6241(5) 0.9944(4)    1.       0
O 5  -2 2 i 0.5774(8) 0.9910(5) 0.1434(5)    1.       0
O 6  -2 2 i 0.0738(8) 0.4890(4) 0.6358(5)    1.       0
O 7  -2 2 i 0.5721(8) 0.9898(4) 0.6373(4)    1.       0
O 8  -2 2 i 0.0719(8) 0.4933(4) 0.1375(5)    1.       0
O 9  -2 2 i 0.8156(8) 0.1011(5) 0.0822(5)    1.       0
O 10 -2 2 i 0.3281(8) 0.5973(4) 0.6000(5)    1.       0
O 11 -2 2 i 0.8098(8) 0.0987(4) 0.6037(5)    1.       0
O 12 -2 2 i 0.2882(8) 0.6029(5) 0.0827(5)    1.       0
O 13 -2 2 i 0.8167(8) 0.8553(5) 0.1414(5)    1.       0
O 14 -2 2 i 0.3003(8) 0.3544(5) 0.6152(5)    1.       0
O 15 -2 2 i 0.8132(8) 0.8543(5) 0.6058(5)    1.       0
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O 17 -2 2 i 0.0117(8) 0.2798(4) 0.1360(5)    1.       0
O 18 -2 2 i 0.5122(8) 0.7777(4) 0.6347(5)    1.       0
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O 22 -2 2 i 0.5132(8) 0.1780(4) 0.6090(4)    1.       0
O 23 -2 2 i 0.0083(8) 0.6908(4) 0.6005(5)    1.       0
O 24 -2 2 i 0.5077(8) 0.1932(5) 0.0983(5)    1.       0
O 25 -2 2 i 0.1852(8) 0.1057(4) 0.1913(4)    1.       0
O 26 -2 2 i 0.6977(8) 0.6073(5) 0.6829(5)    1.       0
O 27 -2 2 i 0.2106(8) 0.1029(5) 0.6843(5)    1.       0
O 28 -2 2 i 0.6946(8) 0.6038(4) 0.1986(4)    1.       0
O 29 -2 2 i 0.2023(7) 0.8723(4) 0.2108(4)    1.       0
O 30 -2 2 i 0.6915(8) 0.3638(5) 0.7292(5)    1.       0
O 31 -2 2 i 0.1762(9) 0.8590(5) 0.7181(5)    1.       0
O 32 -2 2 i 0.6956(9) 0.3664(5) 0.2026(5)    1.       0
Lbl  Type Beta11    Beta22    Beta33    Beta12    Beta13    Beta23
Ca1  Ca2+  0.0042(3) 0.0049(2) 0.0023(1) -.0002(2) 0.0013(2) -.0013(1)
Ca2  Ca2+  0.0036(3) 0.0026(1) 0.0017(1) 0.0008(1) 0.0007(2) -.0002(1)
Ca3  Ca2+  0.0033(5) 0.0025(1) 0.0018(1) 0.0008(2) 0.0005(2) -.0007(1)
Ca4  Ca2+  0.0018(3) 0.0062(2) 0.0062(2) 0.0012(2) -.0002(2) -.0054(2)
Si1  Si4+  0.0025(4) 0.0010(1) 0.0007(1) -.0003(2) 0.0008(2) 0.0001(1)
Si2  Si4+  0.0022(4) 0.0007(1) 0.0007(1) 0.0001(2) 0.0007(2) 0.0001(1)
Al1  Al3+  0.0027(5) 0.0009(1) 0.0007(1) -.0004(2) 0.0011(2) -.0001(1)
Al2  Al3+  0.0019(4) 0.0007(1) 0.0006(1) 0.0002(2) 0.0004(2) 0.0000(1)
Al3  Al3+  0.0026(4) 0.0010(2) 0.0007(1) 0.0008(2) 0.0011(2) 0.0002(1)
Al4  Al3+  0.0025(5) 0.0008(2) 0.0007(1) 0.0004(2) 0.0006(2) 0.0000(1)
Si3  Si4+  0.0025(4) 0.0008(1) 0.0006(1) 0.0006(2) 0.0006(2) 0.0003(1)
Si4  Si4+  0.0025(4) 0.0008(1) 0.0006(1) 0.0002(2) 0.0007(2) -.0001(1)
Al5  Al3+  0.0024(4) 0.0006(1) 0.0008(1) 0.0002(2) 0.0005(2) 0.0000(1)
Al6  Al3+  0.0014(4) 0.0007(1) 0.0011(1) 0.0000(2) 0.0006(2) 0.0002(1)
Si5  Si4+  0.0019(4) 0.0008(1) 0.0010(1) 0.0001(2) 0.0006(2) -.0001(1)
Si6  Si4+  0.0020(4) 0.0007(1) 0.0012(1) 0.0000(2) 0.0007(2) -.0001(1)
Si7  Si4+  0.0020(4) 0.0005(1) 0.0007(1) 0.0003(2) 0.0005(2) 0.0000(1)
Si8  Si4+  0.0021(4) 0.0009(1) 0.0012(1) 0.0002(2) 0.0006(2) 0.0002(1)
Al7  Al3+  0.0024(4) 0.0005(1) 0.0006(1) 0.0003(2) 0.0008(2) 0.0002(1)
Al8  Al3+  0.0025(5) 0.0010(1) 0.0012(1) 0.0003(2) 0.0011(2) 0.0002(1)
O1 O2- 0.006(1) 0.0017(4) 0.0009(3) 0.0003(5) 0.0017(5) 0.0002(3)
O2 O2- 0.006(1) 0.0015(4) 0.0007(3) 0.0014(5) 0.0011(5) 0.0004(3)
O3 O2- 0.005(1) 0.0015(4) 0.0009(3) 0.0008(5) 0.0018(5) 0.0003(3)
O4 O2- 0.007(1) 0.0013(4) 0.0008(3) -.0004(5) 0.0016(5) 0.0001(3)
O5 O2- 0.003(1) 0.0012(4) 0.0014(4) 0.0000(5) 0.0014(6) 0.0001(3)
O6 O2- 0.004(1) 0.0002(3) 0.0019(4) 0.0009(5) 0.0008(6) 0.0004(3)
O7 O2- 0.001(1) 0.0010(4) 0.0012(4) -.0001(5) 0.0009(5) 0.0001(3)
O8 O2- 0.002(1) 0.0005(4) 0.0018(4) 0.0007(5) 0.0000(5) 0.0004(3)
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O10  O2- 0.004(1) 0.0010(3) 0.0019(4) -.0012(5) 0.0020(5) -.0005(3)
O11  O2- 0.004(1) 0.0014(4) 0.0023(4) -.0002(5) 0.0029(6) -.0004(3)
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O15  O2- 0.004(1) 0.0021(4) 0.0018(4) 0.0011(5) 0.0020(5) 0.0012(3)
O16  O2- 0.007(1) 0.0025(4) 0.0053(5) 0.0012(6) 0.0053(7) -.0002(4)
O17  O2- 0.005(1) 0.0009(3) 0.0017(4) -.0004(5) 0.0008(6) 0.0002(3)
O18  O2- 0.004(1) 0.0005(3) 0.0023(4) -.0004(5) 0.0022(5) -.0008(3)
O19  O2- 0.005(1) 0.0008(3) 0.0015(3) 0.0005(5) 0.0012(5) -.0002(3)
O20  O2- 0.003(1) 0.0012(3) 0.0021(4) -.0009(5) 0.0012(5) -.0002(3)
O21  O2- 0.004(1) 0.0011(4) 0.0021(4) 0.0013(5) 0.0009(6) -.0002(3)
O22  O2- 0.003(1) 0.0008(3) 0.0007(3) 0.0004(5) 0.0004(5) 0.0004(3)
O23  O2- 0.006(1) 0.0004(3) 0.0017(4) 0.0007(5) 0.0014(6) -.0001(3)
O24  O2- 0.005(1) 0.0016(4) 0.0010(4) 0.0006(5) 0.0005(6) 0.0001(3)
O25  O2- 0.003(1) 0.0012(4) 0.0013(4) 0.0004(5) -.0001(5) 0.0004(3)
O26  O2- 0.005(1) 0.0018(4) 0.0011(4) 0.0010(5) 0.0002(6) 0.0002(3)
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*data for ICSD #86320
Coll Code 86320
Rec  Date 1999/11/30
Chem Name Calcium Tecto-dialumodisilicate
Structured  Ca (Al2 Si2 O8)
Sum       Al2 Ca1 O8 Si2
ANX       AB2C2X8
Min Name Anorthite
D(calc)    2.76
Title    Structural variation associated with compositional variation and
         order-disorder behavior in anorthite-rich feldspars
Author(s) Angel, R.J.;Carpenter, M.A.;Finger, L.W.
Reference American Mineralogist
         (1990), 75, 150-162
Unit Cell 8.175(1) 12.873(1) 14.170(1) 93.11(1) 115.89(1) 91.28(1)
Vol       1337.8
Z          8
Space Group I -1
SG Number 2
Cryst Sys triclinic
Pearson    aP52
Wyckoff    i28
R Value    .048
Red Cell I  8.175 8.770 9.442 89.871 83.080 84.437 668.902
Trans Red 1.000 0.000 0.000 / 0.500 0.500 0.500 / 0.500 -0.500 0.500
Comments Total SOF on at least one site differs from unity (SOF <
         0.997 resp. SOF > 1.003)
         Compound with mineral name: Anorthite
         The structure has been assigned a PDF number (calculated
         powder diffraction data): 01-089-1462
         Structure type : Bytownite
         X-ray diffraction from single crystal
Atom  # OX SITE    x          y          z          SOF    H
Ca 1  +2 4 i 0.2654(2) 0.9859(2) 0.0872(2)    0.486(4) 0
Ca 2  +2 4 i 0.2682(3) 0.0303(5) 0.5430(6)    0.57(2) 0
Ca 3  +2 4 i 0.7735(2) 0.5357(1) 0.5415(1)    0.513(4) 0
Ca 4  +2 4 i 0.7633(4) 0.5027(7) 0.0775(8)    0.43(2) 0
Si 1  +4 4 i 0.0079(2) 0.1575(1) 0.1041(1)    1.       0
Al 1  +3 4 i 0.0028(2) 0.1634(1) 0.6120(1)    1.       0
Al 2  +3 4 i 0.9995(2) 0.8149(1) 0.1195(1)    1.       0
Si 2  +4 4 i 0.0054(2) 0.8178(1) 0.6117(1)    1.       0
Al 3  +3 4 i 0.6877(2) 0.1121(1) 0.1595(1)    1.       0
Si 3  +4 4 i 0.6762(2) 0.1051(1) 0.6569(1)    1.       0
Si 4  +4 4 i 0.6750(2) 0.8811(1) 0.1805(1)    1.       0
Al 4  +3 4 i 0.6834(2) 0.8746(1) 0.6770(1)    1.       0
O 1  -2 4 i 0.0061(5) 0.1241(2) -.0093(2)    1.       0
O 2  -2 4 i 0.9993(5) 0.1248(2) 0.4901(2)    1.       0
O 3  -2 4 i 0.5739(4) 0.9894(2) 0.1389(2)    1.       0
O 4  -2 4 i 0.5718(4) 0.9908(2) 0.6376(2)    1.       0
O 5  -2 4 i 0.8232(4) 0.0985(2) 0.0926(3)    1.       0
O 6  -2 4 i 0.7990(5) 0.0999(2) 0.5927(3)    1.       0
O 7  -2 4 i 0.8074(5) 0.8552(3) 0.1269(3)    1.       0
O 8  -2 4 i 0.8254(5) 0.8550(3) 0.6175(3)    1.       0
O 9  -2 4 i 0.0123(4) 0.2782(2) 0.1352(2)    1.       0
O 10 -2 4 i 0.0142(4) 0.2932(2) 0.6486(2)    1.       0
O 11 -2 4 i 0.0081(4) 0.6796(2) 0.1071(2)    1.       0
O 12 -2 4 i 0.0077(4) 0.6922(2) 0.5992(2)    1.       0
O 13 -2 4 i 0.1920(4) 0.1069(2) 0.1854(3)    1.       0
O 14 -2 4 i 0.2019(5) 0.1032(2) 0.6919(3)    1.       0
O 15 -2 4 i 0.1970(5) 0.8685(3) 0.2208(3)    1.       0
O 16 -2 4 i 0.1868(5) 0.8637(3) 0.7077(3)    1.       0
Lbl  Type Beta11    Beta22    Beta33    Beta12    Beta13    Beta23
Ca1  Ca2+  0.0027(3) 0.0028(1) 0.0014(1) 0.0002(1) 0.0008(2) -.0007(1)
Ca2  Ca2+  0.0027(3) 0.0017(2) 0.0015(2) 0.0006(1) 0.0004(2) -.0003(2)
Ca3  Ca2+  0.0029(3) 0.0017(1) 0.0012(1) 0.0005(1) 0.0003(1) -.0002(1)
Ca4  Ca2+  0.0026(4) 0.0023(3) 0.0014(3) 0.0006(2) 0.0007(2) -.0004(2)
Si1  Si4+  0.0025(2) 0.0009(1) 0.0009(1) -.0003(1) 0.0006(1) 0.0000(1)
Al1  Al3+  0.0035(2) 0.0010(1) 0.0008(1) -.0001(1) 0.0008(1) 0.0002(1)
Al2  Al3+  0.0039(2) 0.0010(1) 0.0009(1) 0.0003(1) 0.0009(1) 0.0001(1)
Si2  Si4+  0.0029(2) 0.0012(1) 0.0008(1) 0.0002(1) 0.0006(1) 0.0000(1)
Al3  Al3+  0.0027(2) 0.0009(1) 0.0009(1) -.0002(1) 0.0011(1) -.0002(1)
Si3  Si4+  0.0027(2) 0.0008(1) 0.0023(1) -.0002(1) 0.0013(1) -.0002(1)
Si4  Si4+  0.0026(2) 0.0009(1) 0.0020(1) 0.0001(1) 0.0005(1) 0.0003(1)
Al4  Al3+  0.0024(2) 0.0009(1) 0.0013(1) 0.0004(1) 0.0006(1) 0.0004(1)
O1 O2- 0.0145(8) 0.0014(2) 0.0012(2) 0.0006(3) 0.0034(3) 0.0002(1)
O2 O2- 0.0117(8) 0.0013(2) 0.0018(2) -.0001(3) 0.0035(3) 0.0000(1)
O3 O2- 0.0023(5) 0.0007(2) 0.0020(2) 0.0004(2) 0.0007(3) 0.0004(1)
O4 O2- 0.0029(5) 0.0007(2) 0.0018(2) -.0001(2) 0.0008(3) 0.0001(1)
O5 O2- 0.0057(6) 0.0015(2) 0.0051(3) -.0013(3) 0.0041(3) -.0012(2)
O6 O2- 0.0076(7) 0.0016(2) 0.0054(3) -.0017(3) 0.0051(4) -.0011(2)
O7 O2- 0.0055(6) 0.0019(2) 0.0086(4) 0.0007(3) 0.0054(4) 0.0001(2)
O8 O2- 0.0094(8) 0.0020(2) 0.0077(3) 0.0016(3) 0.0071(4) 0.0011(2)
O9 O2- 0.0045(6) 0.0013(2) 0.0018(2) -.0001(2) 0.0014(3) -.0001(1)
O10  O2- 0.0055(6) 0.0012(2) 0.0018(2) -.0007(2) 0.0013(3) 0.0000(1)
O11  O2- 0.0045(6) 0.0009(2) 0.0017(2) 0.0002(2) 0.0009(3) -.0001(1)
O12  O2- 0.0041(5) 0.0012(2) 0.0016(2) 0.0002(2) 0.0007(3) 0.0000(1)
O13  O2- 0.0050(6) 0.0019(2) 0.0021(2) 0.0008(3) -.0012(3) -.0002(2)
O14  O2- 0.0067(7) 0.0013(2) 0.0026(2) 0.0004(3) -.0023(3) 0.0002(2)
O15  O2- 0.0045(6) 0.0023(2) 0.0042(3) 0.0009(3) -.0026(3) -.0015(2)
O16  O2- 0.0096(8) 0.0028(2) 0.0040(3) 0.0027(3) -.0041(4) -.0023(2)
*end for ICSD #86320

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