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robert-xn

银虫 (小有名气)

[求助] 使用亚硫酸氢钠测序法测试基因CpG甲基化

各位仁兄,麻烦问一下有人用亚硫酸氢钠测序法测试过基因CpG甲基化么,因为用亚硫酸盐处理的时候片段会断裂,所以想问问它可以PCR的片段范围一般是多少啊,可以达到600bp么?多谢了
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天高任鸟飞
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lyqifeih

新虫 (小有名气)

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★ ★ ★ ★ ★
robert-xn(金币+3): 认真 2011-08-19 17:46:52
西瓜(金币+5, MolEPI+1): Good!新虫很犀利! 2011-08-19 18:37:34
我一般选择200~400bp,也有P整个CpG岛的,但是效果没有200~400bp好。因为U产生太多的话,DNA不稳定,建议200bp左右。你从组织中提的DNA,BSPCR之后,产量够测序用么?我BSPCR之后,一般还要过表达下,才够测序。
刚进入神经生物和电生理
6楼2011-08-19 14:55:53
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lyqifeih

新虫 (小有名气)

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★ ★
dhd997(金币+2): good 2011-08-19 12:02:57
可以,最好不要那么长,我喜欢200bp测序,这样准确度就很高。
刚进入神经生物和电生理
2楼2011-08-19 10:49:34
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robert-xn

银虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by lyqifeih at 2011-08-19 10:49:34:
可以,最好不要那么长,我喜欢200bp测序,这样准确度就很高。

那再麻烦问一下,如果过长会有什么不好的影响呢?
天高任鸟飞
3楼2011-08-19 10:59:59
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lyqifeih

新虫 (小有名气)

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★ ★
1949stone(金币+2): 鼓励 2011-08-19 13:18:37
请问你是测序么?太长了容易有错配。我毕业论文就是做的甲基化,导师要求不要太长,太长了测序不准。像我现在用HRM技术,就好些,不用测序。
刚进入神经生物和电生理
4楼2011-08-19 12:21:04
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