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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 使用亚硫酸氢钠测序法测试基因CpG甲基化
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robert-xn

银虫 (小有名气)

[求助] 使用亚硫酸氢钠测序法测试基因CpG甲基化

各位仁兄，麻烦问一下有人用亚硫酸氢钠测序法测试过基因CpG甲基化么，因为用亚硫酸盐处理的时候片段会断裂，所以想问问它可以PCR的片段范围一般是多少啊，可以达到600bp么？多谢了
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天高任鸟飞
1楼 2011-08-19 09:09:25
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lyqifeih

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
robert-xn(金币+3): 认真 2011-08-19 17:46:52
西瓜(金币+5, MolEPI+1): Good！新虫很犀利！ 2011-08-19 18:37:34
我一般选择200~400bp，也有P整个CpG岛的，但是效果没有200~400bp好。因为U产生太多的话，DNA不稳定，建议200bp左右。你从组织中提的DNA，BSPCR之后，产量够测序用么？我BSPCR之后，一般还要过表达下，才够测序。
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刚进入神经生物和电生理
6楼2011-08-19 14:55:53
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lyqifeih

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
dhd997(金币+2): good 2011-08-19 12:02:57
可以，最好不要那么长，我喜欢200bp测序，这样准确度就很高。
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刚进入神经生物和电生理
2楼2011-08-19 10:49:34
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robert-xn

银虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by lyqifeih at 2011-08-19 10:49:34:
可以，最好不要那么长，我喜欢200bp测序，这样准确度就很高。

那再麻烦问一下，如果过长会有什么不好的影响呢？
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天高任鸟飞
3楼2011-08-19 10:59:59
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lyqifeih

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
1949stone(金币+2): 鼓励 2011-08-19 13:18:37
请问你是测序么？太长了容易有错配。我毕业论文就是做的甲基化，导师要求不要太长，太长了测序不准。像我现在用HRM技术，就好些，不用测序。
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刚进入神经生物和电生理
4楼2011-08-19 12:21:04
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