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使用亚硫酸氢钠测序法测试基因CpG甲基化
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robert-xn
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使用亚硫酸氢钠测序法测试基因CpG甲基化
各位仁兄,麻烦问一下有人用亚硫酸氢钠测序法测试过基因CpG甲基化么,因为用亚硫酸盐处理的时候片段会断裂,所以想问问它可以PCR的片段范围一般是多少啊,可以达到600bp么?多谢了
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1楼
2011-08-19 09:09:25
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dhd997(金币+3): 鼓励交流 2011-08-21 09:12:12
引用回帖:
9楼
:
Originally posted by
77747759
at 2011-08-20 16:12:37:
那请教有些公司 甲基化测序和甲基化芯片是怎么回事????
市场上,现在比较流行的甲基化测序有焦磷酸测序,这个方法教昂贵,就是数据好看些,他给你的结果是甲基化的百分比。也就说你样品中甲基化的程度。
做甲基化的方法当然很多了,包括甲基化芯片,这个方法没有多大意思,费用非常高,我做个一次,结果不理想,花了25000. 变性质谱技术、HRM(高分辨溶解曲线)等、MSPCR和BSPCR技术等等。比较适合科研院所做的就是MSPCR和BSPCR,费用比较低。当然HRM方法也不错。
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刚进入神经生物和电生理
10楼
2011-08-21 08:50:49
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dhd997(金币+2): good 2011-08-19 12:02:57
可以,最好不要那么长,我喜欢200bp测序,这样准确度就很高。
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刚进入神经生物和电生理
2楼
2011-08-19 10:49:34
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2楼
:
Originally posted by
lyqifeih
at 2011-08-19 10:49:34:
可以,最好不要那么长,我喜欢200bp测序,这样准确度就很高。
那再麻烦问一下,如果过长会有什么不好的影响呢?
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天高任鸟飞
3楼
2011-08-19 10:59:59
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1949stone(金币+2): 鼓励 2011-08-19 13:18:37
请问你是测序么?太长了容易有错配。我毕业论文就是做的甲基化,导师要求不要太长,太长了测序不准。像我现在用HRM技术,就好些,不用测序。
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刚进入神经生物和电生理
4楼
2011-08-19 12:21:04
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