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sky_flys

金虫 (著名写手)

[求助] 100金币求解决如下问题,谢谢啦

各位大牛,
  我有一个晶体结构,在不加氢的情况下基本可以消除A类错误,可是每次加上氢(无论是理论加氢还是从Q峰中找氢),都会出现如下的错误:
PLAT241_ALERT_2_A Check High    Ueq as Compared to Neighbors for     C22     
PLAT430_ALERT_2_A Short Inter D...A Contact  O9     ..  O14     ..       2.52 Ang.

不知道哪位大侠可以帮忙处理一下啊?
谢谢了!!
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knight1014

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖


sky_flys(金币+10): 2011-08-17 08:45:06
lichun1210(金币+1): 欢迎常来晶体版交流。 2011-08-18 16:31:01
PLAT241_ALERT_2_A Check High    Ueq as Compared to Neighbors for     C22     
PLAT430_ALERT_2_A Short Inter D...A Contact  O9     ..  O14     ..       2.52 Ang.
第一个问题,你可以把和C22相连的原子的Ueq值改大点,同时把C22的Ueq值改小点,固定下来,这活需要细心,慢慢来调整。
第二个问题,这两个O离得这么近,可以将其占有率改成各为50%,看椭球率正常的话就可以加氢了。
3楼2011-08-16 20:30:00
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romanticch

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


sky_flys(金币+5): 2011-08-17 08:42:43
sky_flys(金币+5): 2011-08-17 08:45:13
lichun1210(金币+1): 谢谢参与,欢迎常来晶体版交流! 2011-08-22 00:23:07
用rigid body修 应该问题能解决
2楼2011-08-16 19:20:40
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sky_flys

金虫 (著名写手)

请教romanticch :rigid body怎么用?
4楼2011-08-17 08:42:54
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sky_flys

金虫 (著名写手)

请教knight1014 :
Ueq可以随意改动?
主要是O14已经是经过无序处理的,而且占有率已经调为50%了,O9是羧基上的,上面没有氢原子了
5楼2011-08-17 08:44:59
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