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tiechong

金虫 (著名写手)

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[交流] Gaussian里NBO里的Choose关键词

用Gaussian里NBO分析, 在最后加Choose来制定键的类型, 每次都报错, 有没有虫子用过?

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1楼 2011-08-11 00:49:07

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sealanlan

铁虫 (正式写手)

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★
tiechong(金币+1):谢谢参与

引用回帖:

2楼: Originally posted by sobereva at 2011-08-11 13:02:16:
用pop=nboread关键词，然后再分子坐标后面空一行写上诸如（详见NBO5 manual B.4）
$NBO $END
$CHOOSE
ALPHA
LONE 1 3
   3 3
   4 3 END
BOND S 1 2
   S 3 4 END
END
BETA
LONE 1 3
   3 1
...

照着这个格式设定了，跑一段时间过后，还是出错，什么原因呢？错误信息如下：
Unrecognized atomic symbol:
$NB
Error termination via Lnk1e in /home/gauss/g03/l602.exe at Tue Sep  6 07:24:27 2011.
Job cpu time:  0 days 10 hours 36 minutes 51.8 seconds.
File lengths (MBytes):  RWF= 452 Int=    0 D2E=    0 Chk=    20 Scr=    1

输入文件会不会有问题呢，我的设定如下：
%chk=03a.chk
%mem=3500MB
#p sp b3lyp/6-31+g(d) pop=(chelpg,ReadRadii,full,nboread,)

03a

-1 1
H                -5.12312700 5.23900200 0.38202900
C                -4.23347300 4.68088200 0.09578600
C                -3.56868200 4.96589200 -1.10298100
C                -3.76388900 3.66161800 0.91722100
C                -2.42969400 4.23935400 -1.43635000
H                -3.92988300 5.74914800 -1.76561100
H                -4.28761400 3.41748800 1.83800200
C                -2.62055600 2.90399000 0.57950000
C                -1.92969700 3.20707200 -0.61794200
H                -1.87484400 4.46830300 -2.34004700
S                -2.13512400 1.64452700 1.72494700
C                -0.62214800 2.60614000 -1.10233900
Fe             -1.27285500 0.00052300 0.32046000
O                0.07914700 3.33607600 -1.83120900
N                -0.28111000 1.32537100 -0.77088700
S                -2.13607700 -1.64541800 1.72208900
O                -3.66889600 -0.00816100 -1.04391100
N                -0.28103800 -1.32257400 -0.77353400
N                -2.65374700 -0.00070700 -0.49893200
N                0.44861600 -0.00136000 1.57927400
C                0.86849500 0.71518500 -1.31691800
C                -2.61959000 -2.90455500 0.57546900
C                -0.62071700 -2.60359600 -1.10543100
C                0.86854900 -0.71121900 -1.31839200
C                1.05907600 -1.14699100 1.93591500
C                1.05966800 1.14333800 1.93795800
C                1.99795100 1.39699300 -1.79961500
C                -3.76239400 -3.66346100 0.91209100
C                -1.92783200 -3.20613900 -0.62183100
O                0.08158400 -3.33269200 -1.83420200
C                1.99815800 -1.39175700 -1.80263400
H                0.55925400 -2.05899300 1.63656900
C                2.25398900 -1.19950300 2.63493700
C                2.25460100 1.19396200 2.63708700
H                0.56029400 2.05611500 1.64022500
C                3.11336400 0.69952800 -2.26344200
H                1.99721600 2.47538800 -1.81780800
H                -4.28684300 -3.42039200 1.83274000
C                -4.23055500 -4.68269000 0.08980900
C                -2.42645000 -4.23838900 -1.44114800
H                1.99764700 -2.47009800 -1.82312400
C                3.11343100 -0.69306200 -2.26496800
H                2.67218800 -2.17378500 2.85502300
C                2.90422600 -0.00328100 3.01596000
H                2.67330900 2.16762700 2.85892200
Cl                4.50183800 1.62852800 -2.83188300
H                -5.11981900 -5.24184500 0.37523900
H                -1.87099200 -4.46620600 -2.34474800
Cl                4.50201700 -1.62062100 -2.83552200
N                4.09480400 -0.00419500 3.71154900
C                4.82642800 -1.25338900 3.87319200
C                4.82705200 1.24437000 3.87532100
H                5.71183900 -1.06894600 4.48547600
H                4.21332700 -1.99890200 4.39179900
H                5.14969200 -1.67926400 2.91046900
H                5.71243800 1.05842900 4.48718200
H                5.15042300 1.67177300 2.91331400
H                4.21435100 1.98927700 4.39528600
C                -3.56486600 -4.96628500 -1.10879000
H                -3.92495200 -5.74946600 -1.77211700

$NBO $END
$CHOOSE
BOND
      S 13 11
      S 13 16
      S 13 19
      S 13 20
      D 19 17 END
$END

Fe 1.95

[ Last edited by sealanlan on 2011-9-7 at 20:22 ]

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3楼2011-09-07 20:11:49

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sobereva

至尊木虫 (著名写手)

★
tiechong(金币+1):谢谢参与
tiechong(金币+10): 2011-08-13 06:08:31

用pop=nboread关键词，然后再分子坐标后面空一行写上诸如（详见NBO5 manual B.4）
$NBO $END
$CHOOSE
ALPHA
LONE 1 3
   3 3
   4 3 END
BOND S 1 2
   S 3 4 END
END
BETA
LONE 1 3
   3 1
   4 1 END
BOND S 1 2
   T 3 4 END
END
$END

[ Last edited by sobereva on 2011-8-11 at 13:29 ]

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2楼2011-08-11 13:02:16

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