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tiechong

金虫 (著名写手)

[交流] Gaussian里NBO里的Choose关键词

用Gaussian里NBO分析, 在最后加Choose来制定键的类型, 每次都报错, 有没有虫子用过?
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1楼 2011-08-11 00:49:07
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sealanlan

铁虫 (正式写手)
★
tiechong(金币+1):谢谢参与
引用回帖:
2楼: Originally posted by sobereva at 2011-08-11 13:02:16:
用pop=nboread关键词，然后再分子坐标后面空一行写上诸如（详见NBO5 manual B.4）
$NBO $END
$CHOOSE
ALPHA
LONE 1 3
     3 3
     4 3 END
BOND S 1 2
     S 3 4 END
END
BETA
LONE 1 3
     3 1
...

照着这个格式设定了，跑一段时间过后，还是出错，什么原因呢？错误信息如下：
Unrecognized atomic symbol:
$NB
Error termination via Lnk1e in /home/gauss/g03/l602.exe at Tue Sep  6 07:24:27 2011.
Job cpu time:  0 days 10 hours 36 minutes 51.8 seconds.
File lengths (MBytes):  RWF=    452 Int=      0 D2E=      0 Chk=     20 Scr=      1

输入文件会不会有问题呢，我的设定如下：
%chk=03a.chk
%mem=3500MB
#p sp b3lyp/6-31+g(d) pop=(chelpg,ReadRadii,full,nboread,)

03a

-1 1
H                 -5.12312700    5.23900200    0.38202900
C                 -4.23347300    4.68088200    0.09578600
C                 -3.56868200    4.96589200   -1.10298100
C                 -3.76388900    3.66161800    0.91722100
C                 -2.42969400    4.23935400   -1.43635000
H                 -3.92988300    5.74914800   -1.76561100
H                 -4.28761400    3.41748800    1.83800200
C                 -2.62055600    2.90399000    0.57950000
C                 -1.92969700    3.20707200   -0.61794200
H                 -1.87484400    4.46830300   -2.34004700
S                 -2.13512400    1.64452700    1.72494700
C                 -0.62214800    2.60614000   -1.10233900
Fe                -1.27285500    0.00052300    0.32046000
O                  0.07914700    3.33607600   -1.83120900
N                 -0.28111000    1.32537100   -0.77088700
S                 -2.13607700   -1.64541800    1.72208900
O                 -3.66889600   -0.00816100   -1.04391100
N                 -0.28103800   -1.32257400   -0.77353400
N                 -2.65374700   -0.00070700   -0.49893200
N                  0.44861600   -0.00136000    1.57927400
C                  0.86849500    0.71518500   -1.31691800
C                 -2.61959000   -2.90455500    0.57546900
C                 -0.62071700   -2.60359600   -1.10543100
C                  0.86854900   -0.71121900   -1.31839200
C                  1.05907600   -1.14699100    1.93591500
C                  1.05966800    1.14333800    1.93795800
C                  1.99795100    1.39699300   -1.79961500
C                 -3.76239400   -3.66346100    0.91209100
C                 -1.92783200   -3.20613900   -0.62183100
O                  0.08158400   -3.33269200   -1.83420200
C                  1.99815800   -1.39175700   -1.80263400
H                  0.55925400   -2.05899300    1.63656900
C                  2.25398900   -1.19950300    2.63493700
C                  2.25460100    1.19396200    2.63708700
H                  0.56029400    2.05611500    1.64022500
C                  3.11336400    0.69952800   -2.26344200
H                  1.99721600    2.47538800   -1.81780800
H                 -4.28684300   -3.42039200    1.83274000
C                 -4.23055500   -4.68269000    0.08980900
C                 -2.42645000   -4.23838900   -1.44114800
H                  1.99764700   -2.47009800   -1.82312400
C                  3.11343100   -0.69306200   -2.26496800
H                  2.67218800   -2.17378500    2.85502300
C                  2.90422600   -0.00328100    3.01596000
H                  2.67330900    2.16762700    2.85892200
Cl                 4.50183800    1.62852800   -2.83188300
H                 -5.11981900   -5.24184500    0.37523900
H                 -1.87099200   -4.46620600   -2.34474800
Cl                 4.50201700   -1.62062100   -2.83552200
N                  4.09480400   -0.00419500    3.71154900
C                  4.82642800   -1.25338900    3.87319200
C                  4.82705200    1.24437000    3.87532100
H                  5.71183900   -1.06894600    4.48547600
H                  4.21332700   -1.99890200    4.39179900
H                  5.14969200   -1.67926400    2.91046900
H                  5.71243800    1.05842900    4.48718200
H                  5.15042300    1.67177300    2.91331400
H                  4.21435100    1.98927700    4.39528600
C                 -3.56486600   -4.96628500   -1.10879000
H                 -3.92495200   -5.74946600   -1.77211700

$NBO $END
$CHOOSE
    BOND     
         S 13 11
         S 13 16
         S 13 19
         S 13 20
         D 19 17 END
$END

Fe 1.95

[ Last edited by sealanlan on 2011-9-7 at 20:22 ]
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3楼2011-09-07 20:11:49
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sobereva

至尊木虫 (著名写手)
★
tiechong(金币+1):谢谢参与
tiechong(金币+10): 2011-08-13 06:08:31
用pop=nboread关键词，然后再分子坐标后面空一行写上诸如（详见NBO5 manual B.4）
$NBO $END
$CHOOSE
ALPHA
LONE 1 3
     3 3
     4 3 END
BOND S 1 2
     S 3 4 END
END
BETA
LONE 1 3
     3 1
     4 1 END
BOND S 1 2
     T 3 4 END
END
$END

[ Last edited by sobereva on 2011-8-11 at 13:29 ]
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2楼2011-08-11 13:02:16
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10010602004

铁虫 (小有名气)
★
tiechong(金币+1):谢谢参与
怎么会有Fe呢？你是用赝势吗？
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4楼2011-11-11 18:30:57
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emmaxue

木虫 (正式写手)
★
tiechong(金币+1):谢谢参与
本身基组选择就有问题
该用自定义，选择赝势
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5楼2011-11-18 09:14:05
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