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happywoheni铁虫 (小有名气)
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关于进化树
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在ncbi上blast之后出现了几十条序列,要统统做成进化树吗?还是只要做我这个属的菌。 用DNAMAN做进化树的时候,菌名太长,不能完全显示,有什么办法吗? |
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【分子生物】EPI帖 |
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jinkui960
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3楼2011-08-06 11:54:28
jinkui960
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【答案】应助回帖
happywoheni(金币+1): 2011-08-06 14:15:20
1949stone(MolEPI+1): 同意 好多都可以构架进化树 mega是比较低级的 2011-08-06 16:54:36
1949stone(MolEPI+1): 同意 好多都可以构架进化树 mega是比较低级的 2011-08-06 16:54:36
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1), 在ncbi上blast之后出现了几十条序列,不需要都用来构进化树,同一个属每个种选择1-2个序列,最好选择确定到种的序列和标准菌株的序列,其他属的根据实际情况选择1-2个序列,也可以多选一点作为对比序列和外群。 2) DNAMAN不是做进化树常用软件,初学者可以选择Mega软件进行构树,一般的软件构树以后都会出现菌名显示不全等问题,处理的方法也很简单,一般可以把构的进化树的图拷贝到Powerpoint里面,点击右键,出现右键菜单,点击组合,选择取消组合,以后你就可以对菌种名称进行修改,包括字体大小,格式等都可以按照要求进行修改! 祝好运! |
2楼2011-08-06 11:52:57
gengyuehua
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