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happywoheni

铁虫 (小有名气)

[求助] 关于进化树

在ncbi上blast之后出现了几十条序列,要统统做成进化树吗?还是只要做我这个属的菌。
用DNAMAN做进化树的时候,菌名太长,不能完全显示,有什么办法吗?
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jinkui960

至尊木虫 (知名作家)

【答案】应助回帖

happywoheni(金币+1): 2011-08-06 14:15:20
1949stone(MolEPI+1): 同意 好多都可以构架进化树 mega是比较低级的 2011-08-06 16:54:36
引用回帖:
1楼: Originally posted by happywoheni at 2011-08-06 11:03:16:
在ncbi上blast之后出现了几十条序列,要统统做成进化树吗?还是只要做我这个属的菌。
用DNAMAN做进化树的时候,菌名太长,不能完全显示,有什么办法吗?

1), 在ncbi上blast之后出现了几十条序列,不需要都用来构进化树,同一个属每个种选择1-2个序列,最好选择确定到种的序列和标准菌株的序列,其他属的根据实际情况选择1-2个序列,也可以多选一点作为对比序列和外群。

2) DNAMAN不是做进化树常用软件,初学者可以选择Mega软件进行构树,一般的软件构树以后都会出现菌名显示不全等问题,处理的方法也很简单,一般可以把构的进化树的图拷贝到Powerpoint里面,点击右键,出现右键菜单,点击组合,选择取消组合,以后你就可以对菌种名称进行修改,包括字体大小,格式等都可以按照要求进行修改!

祝好运!
2楼2011-08-06 11:52:57
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jinkui960

至尊木虫 (知名作家)

【答案】应助回帖

用DNAMAN构建的进化树图的编辑也可以采用上面提到的方法!
3楼2011-08-06 11:54:28
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gengyuehua

木虫 (正式写手)


西瓜(金币+1): 鼓励交流 2011-08-11 12:03:34
mega的系统树可以在word编辑。
4楼2011-08-11 08:41:57
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