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汕头大学海洋科学接受调剂
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fubao-411

木虫 (小有名气)

[求助] 计算石墨烯不收敛的问题

Sample Text    我用ATK 计算石墨烯的透射谱,电极选用一个单胞时,计算是收敛的,后来我又算了下电极选用2个单胞时的情况,计算不收敛了,运行了4天后提示“exceeded the maximum number of the iteration”。理论上,电极是越长越好,但这里为什么会不收敛呢
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轻松走一回!
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uuv2010

荣誉版主 (职业作家)

优秀版主

【答案】应助回帖

★ ★
franch(金币+2): 谢谢回帖交流 2011-08-01 21:28:46
fubao-411(金币+3): 谢谢,今天补上 2011-08-03 16:16:37
是不是自洽步数设置的太小了?增大一点试一试。
2楼2011-08-01 12:12:08
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fubao-411

木虫 (小有名气)

我也想过可能是这个问题,自洽默认是100步,建模时我都是精确到了小数点后4位,并且是在ATK内优化完成的,1单胞电极没出现这个问题,2单胞电极就出现这个问题,
轻松走一回!
3楼2011-08-02 10:41:16
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fubao-411

木虫 (小有名气)

按下“回帖评分”没反应,草的......
轻松走一回!
4楼2011-08-02 10:47:25
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太白击剑

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
fubao-411(金币+7): 谢谢,我再试试 2011-08-03 16:17:19
gzqdyouxia(金币+2): 谢谢指导 2011-08-04 20:20:19
还有可能是k点取少了,可以增大一点试试;另外一种方法是增加温度,先在在较高的温度下计算一个.nc文件,然后再将温度调到你所需要的值(一般是300k),再以这个文件为初始电荷分布计算体系的.nc文件
5楼2011-08-02 17:26:51
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guohuazhon

木虫 (正式写手)

★ ★
gzqdyouxia(金币+2): 谢谢指导 2011-08-04 20:19:57
为了节省计算时间,加快收敛速度,可以尝试以下设置:
• Basis set parameters: Type = SingleZetaPolarized (saves time and memory, without compromising the accuracy substantially for gold)
• Brillouin zone integration parameters: Number of k-points = 5 x 5 x 100
• Electron density parameters: Mesh cut-off = 200 Ry
• Eigenstate occupation parameters: Electron temperature = 1000 K
• Iteration mixing parameters: Diagonal mixing parameter =0.05
楼上说的很有道理。
6楼2011-08-04 19:56:52
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guohuazhon

木虫 (正式写手)

★ ★
gzqdyouxia(金币+2): 谢谢提示 2011-08-04 20:19:35
你还可以用下面的脚本来检验K点设置多少合适,计算时N取值到多少看你自己了,这里只取到10
from ATK.TwoProbe import *
from ATK.MPI import processIsMaster
checkpoint_file = "×.nc"
scf = restoreSelfConsistentCalculation(checkpoint_file)
for N in range(1,10):
kpoints = brillouinZoneIntegrationParameters((N, N))
transmission_spectrum = calculateTransmissionSpectrum(
self_consistent_calculation = scf,
energies = (0.0,)*electronVolt,
brillouin_zone_integration_parameters = kpoints, )
if processIsMaster():
print N, transmission_spectrum.coefficients()[0]
7楼2011-08-04 20:00:56
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fubao-411

木虫 (小有名气)

多谢楼上几位  
轻松走一回!
8楼2011-08-06 11:05:25
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kaypu

铁杆木虫 (小有名气)


★ ★
franch(金币+2): 谢谢回帖交流 2011-08-30 11:05:06
引用回帖:
1楼: Originally posted by fubao-411 at 2011-08-01 10:17:00:
Sample Text    我用ATK 计算石墨烯的透射谱,电极选用一个单胞时,计算是收敛的,后来我又算了下电极选用2个单胞时的情况,计算不收敛了,运行了4天后提示“exceeded the maximum number of t ...

交换关联 可以用LDA 我记得有篇文章提到过这个问题LDA和GGA计算石墨烯的时候差别不大,不知道有没有记错,但是 LDA比较容易收敛,你可以试一下
9楼2011-08-28 10:25:25
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fubao-411

木虫 (小有名气)

引用回帖:
9楼: Originally posted by kaypu at 2011-08-28 10:25:25:
交换关联 可以用LDA 我记得有篇文章提到过这个问题LDA和GGA计算石墨烯的时候差别不大,不知道有没有记错,但是 LDA比较容易收敛,你可以试一下

多谢
轻松走一回!
10楼2011-08-30 08:38:34
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