| 查看: 3519 | 回复: 13 | |||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | |||
hnuzhoulin金虫 (小有名气)
|
[求助]
原来编译的siesta突然不能用，重新编译没错，运行出错
|
||
|
前几天才尝试用gfortran和mpich2编译siesta，通过了，并且在test目录和example、目录下都能够计算得到差不多的结果。由于当时安装的mpich2用的是mpd，后来改用新版的mpich2换hydra作为进程调度的系统，于是重新编译了一下：这次尝试用ifort10+mpich2，编译过程没什么错误，但是在test目录下make，得到的错误如下： 于是我将可执行文件拷贝到第一次正确运行（gfortran编译成功那次）的目录，再次 ./siesta initatom: Reading input for the pseudopotentials and atomic orbitals ---------- Species number: 1 Label: O Atomic number: 8 Species number: 2 Label: H Atomic number: 1 Ground state valence configuration: 2s02 2p04 Reading pseudopotential information in formatted form from O.psf Semicore shell(s) with -5 electrons included in the valence for O Ground state valence configuration: 1s01 Reading pseudopotential information in formatted form from H.psf O must be in PAO.Basis (it has semicore states) Stopping Program from Node: 0 application called MPI_Abort(MPI_COMM_WORLD, 1) - process 0 [unset]: aborting job: application called MPI_Abort(MPI_COMM_WORLD, 1) - process 0 不明白啊，为啥编译没问题，运行却出错？？ 还有曾经还编译出一个版本，在前台可以算，rocks集群系统交到后台有进程，但是不计算，郁闷啊。 求教。 [ Last edited by hnuzhoulin on 2011-7-19 at 16:02 ] |
回复此楼» 猜你喜欢
26年申博自荐-计算机视觉
已经有4人回复
-
考博
已经有4人回复
-
药化及相关博士的申请
已经有3人回复
-
一篇MDPI论文改变了学习工作和生活
已经有4人回复
-
一个化合物的合成路线：CAS:367929-02-0 名称：8β-乙烯基雌二醇
已经有4人回复
-
中国地质大学（北京）博士招生补录，数理学院材料科学与工程专业和材料与化工专业
已经有3人回复
-
收到国自然专家邀请后几年才会有本子送过来评
已经有3人回复
13楼2011-10-10 16:44:56
2楼2011-07-19 20:22:05
hnuzhoulin
金虫 (小有名气)
- 1ST强帖: 1
- 应助: 7 (幼儿园)
- 金币: 1202.8
- 红花: 6
- 帖子: 265
- 在线: 49小时
- 虫号: 778409
- 注册: 2009-05-24
- 性别: GG
- 专业: 计算机应用技术
3楼2011-07-20 11:09:27
dxcharlary
专家顾问 (职业作家)
-
专家经验: +83 - 1ST强帖: 2
- 应助: 251 (大学生)
- 金币: 10439.1
- 散金: 155
- 红花: 65
- 帖子: 3137
- 在线: 757.6小时
- 虫号: 936718
- 注册: 2010-01-04
- 专业: 凝聚态物性I:结构、力学和
- 管辖: 第一性原理
4楼2011-07-20 11:59:35