| 查看: 676 | 回复: 1 | ||
jwell金虫 (小有名气)
|
[求助]
dalton 求助
|
| dalton 2.0安装成功了，也得到了makefile.config 文件。test 的测试文件也能运行。但在输入命令进行计算时dalton却无法进行。并且dalton命令都不能用,>dalton -h 也无法用。求高手指点一下。 |
回复此楼» 猜你喜欢
智能微系统实验室-北京信息科技大学-2025年秋季入学博士招生
已经有5人回复
-
汕头大学化学招调剂，相关内容如下。
已经有4人回复
-
物理化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有78人回复
-
已知面上挂了，小学校实验方向无平台，感觉太难了
已经有26人回复
-
求助各位大佬，球球了，在这科萨头
已经有0人回复
-
七嗪类物质合成求助
已经有0人回复
-
半透性容器进行高湿或者低湿研究
已经有0人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 求助关于Dalton投稿的信息咨询
已经有4人回复
- 急+急，求助多糖类摘要翻译
已经有1人回复
- 【求助】嵌段共聚物如何表征
已经有25人回复
- 【求助】大家帮忙分析一下我这样能申请到美国的PHD吗？
已经有42人回复
- Dalton Transactions的审稿周期，急了啊，三个月了。。。
已经有7人回复
- 【求助】合金与金属间化合物的区别
已经有4人回复
- 【求助】求助crystal09软件包
已经有9人回复
- 【求助】非水溶性的两亲高聚物如何提纯
已经有11人回复
- 【求助】大家做CCSD计算都用什么软件？
已经有3人回复
- 【求助】理论与计算化学新手求教
已经有13人回复
- 【求助】国内外化学权威期刊有哪些
已经有10人回复
- 【求助】dalton-2.0编译及测试问题【完结】
已经有18人回复
wuy069
铁杆木虫 (正式写手)
- 应助: 20 (小学生)
- 金币: 7921.9
- 散金: 15
- 红花: 10
- 帖子: 506
- 在线: 549.1小时
- 虫号: 760723
- 注册: 2009-04-30
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
【答案】应助回帖
★ ★
gmy1990(金币+2): 非常感谢你对论坛的贡献，奖励一下！ 2011-07-10 21:10:07
jwell(金币+50): 谢谢。我的是在电脑上算的应该不用并行吧。如果不并行的话是不是上面就不用设了。还有我在发帖之后找到了方法，现在能计算了，也有结果。我用的是test中的一个输入文件下的.dalhe.mol文件。就是不知道结果对不对。呵呵！ 2011-07-11 09:19:21
gmy1990(金币+2): 非常感谢你对论坛的贡献，奖励一下！ 2011-07-10 21:10:07
jwell(金币+50): 谢谢。我的是在电脑上算的应该不用并行吧。如果不并行的话是不是上面就不用设了。还有我在发帖之后找到了方法，现在能计算了，也有结果。我用的是test中的一个输入文件下的.dalhe.mol文件。就是不知道结果对不对。呵呵！ 2011-07-11 09:19:21
|
你确定编译好了？ 如果编译好了，你把环境变量写好了，不就可以调用dalton了吗，也就可以使用dalton命令。实在不行，你就用绝对路径来通任务就可以。 编译时你用mpi了，通任务之前你还得运行mpd吧。 下面是我写的一个简单粗糙的pbs脚本，仅供参考； #!/bin/bash # #PBS -l nodes=1:ppn=12 #PBS -l walltime=2400:00:00 #PBS -j oe #PBS -V # go to work dir cd $PBS_O_WORKDIR # The program we want to execute (modify to suit your setup) #EXEC=/share/apps/dalton-2.0-cam/bin/dalpar.x # setup mpd env (Of course use some other secret word than "dfadfs"  if [ ! -f ~/.mpd.conf ]; then /bin/echo "secretword=dfadfs" >> ~/.mpd.conf /bin/chmod 600 ~/.mpd.conf fi ########################################################## # The following should be no need to # change any of these settings for normal use. ########################################################## jobname=rsp_lrso # Intel MPI Home MPI_HOME=/opt/intel/impi/4.0.0.027 # setup Nums of Processor NP=`cat $PBS_NODEFILE|wc -l` echo "Numbers of Processors: $NP" echo "---------------------------" # Number of MPD N_MPD=`cat $PBS_NODEFILE|uniq|wc -l` echo "started mpd Number: $N_MPD" echo "---------------------------" # setup mpi env (em64t) $MPI_HOME/bin64/mpdclean -r ssh -f $PBS_NODEFILE $MPI_HOME/bin64/mpdboot -r ssh -n $N_MPD -f $PBS_NODEFILE # running program /share/apps/dalton-2.0-cam/bin/dalton -N 4 $jobname $jobname # clean $MPI_HOME/bin64/mpdallexit |
2楼2011-07-10 21:06:01