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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 专业学科区 » 农林 » 林学 » T-RFLP数据分析求助？
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web1_008

金虫 (小有名气)

[求助] T-RFLP数据分析求助？

求助一下大家，我目前正在做土壤真菌的T-RFLP。现在在分析数据，但是还没有弄清楚如何分析。老是说我格式有错误。有做过这方面的同学么。可以指导一下么。十分感谢！
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1楼 2011-07-05 09:54:33
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web1_008

金虫 (小有名气)
xiadongliang
我的数据是片段大小的数据，还没有分析，不知道什么软件分析比较好。
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4楼2011-08-01 08:22:21
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web1_008

金虫 (小有名气)
送鲜花一朵
引用回帖:
5楼: Originally posted by xiadongliang at 2011-08-01 09:21:15:
你要什么方面的分析啊，建个树？确定真菌种类？还是丰度？

你好，我想确定真菌种类，丰度，多样性指数等。这个可以做到么？
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6楼2011-08-01 23:54:32
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web1_008

金虫 (小有名气)
送鲜花一朵
引用回帖:
9楼: Originally posted by wvkq at 2011-08-29 21:27:02:
这个不是景观生态指数里面的吗？

景观也用这个数据么？我现在就搞不清了，分析起来很费劲。还在研究中。
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10楼2011-08-30 10:44:00
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web1_008

金虫 (小有名气)
谢谢大家，经过研究，已经把T-RFLP的数据分析出来了。
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11楼2012-01-07 17:46:38
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web1_008

金虫 (小有名气)
送鲜花一朵
引用回帖:
楼: Originally posted by xiadongliang at 2011-08-02 08:46:24:
http://mica.ibest.uidaho.edu/pat.php
这个网站看看。

谢谢你，我已经分析出来了
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12楼2012-01-07 17:48:24
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web1_008

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2384735楼: Originally posted by lyj290883 at 2012-04-08 12:25:57:
你好，我最近也在做T-RFLP，数据分析这一块一点头绪也没有，能否指点指点？

你好，不知道你是指数据分析那块么？
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14楼2012-04-08 14:08:55
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web1_008

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2462117楼: Originally posted by zhangtiui at 2012-12-04 21:24:22
我弱弱的问一句，细菌的种类，丰度，多样性指数等在哪可以查到怎么分析？我现在还没弄明白genemarker怎么用

你好，细菌的种类得不到的，有一些网站可以比对，不过不是很准啊。丰度，多样性指数需要用biodap软件计算才行。
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18楼2012-12-06 09:01:04
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web1_008

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2490523楼: Originally posted by 672234993 at 2013-04-02 21:06:41
楼主您好，请问一下你那里有没有做T-RFLP的实验方法啊？我是新手，需要学习。

你说做T-RFLP的方法么？具体什么方法呢？细菌还是真菌啊？
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20楼2013-04-03 08:55:54
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web1_008

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2490627楼: Originally posted by 672234993 at 2013-04-03 09:17:06
是的，我想细菌和真菌都做，你们在实际做的时候是怎么保护荧光的啊？上次我做了一批，送到公司里面跑最后的毛细管电泳的时候，那边说我的荧光没有了。...

送样的时候要用锡箔纸包好。
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22楼2013-04-04 09:28:59
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