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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » Run autogrid 出现错误
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花半开

新虫 (初入文坛)

[求助] Run autogrid 出现错误

本人windows系统下安装的autodock4.2
Run autogrid 时出现如下错误；求高手支招，感激不尽


ERROR *********************************************
Traceback (most recent call last):
  File "C:\Program Files\MGLTools 1.5.6rc1\MGLToolsPckgs\ViewerFramework\VF.py", line 898, in tryto
    result = command( *args, **kw )
  File "C:\Program Files\MGLTools 1.5.6rc1\MGLToolsPckgs\AutoDockTools\autostartCommands.py", line 898, in doit
    cmd = ("cd \"%s\" && "+cmd ) % wd
TypeError: cannot concatenate 'str' and 'list' objects
Exception in Tkinter callback
Traceback (most recent call last):
  File "C:\Python25\lib\lib-tk\Tkinter.py", line 1403, in __call__
    return self.func(*args)
  File "C:\Python25\lib\lib-tk\Tkinter.py", line 498, in callit
    func(*args)
  File "C:\Program Files\MGLTools 1.5.6rc1\MGLToolsPckgs\AutoDockTools\autostartCommands.py", line 958, in saveLog
    if self.WinCmd.ok.configure()['state'][-1] == 'normal':
AttributeError: AutoGridStarter instance has no attribute 'WinCmd'
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1楼 2011-07-02 12:33:48
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icedreamer

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
花半开(金币+1): 谢谢！！！ 2011-07-08 12:49:51
ghcacj(金币+3): 谢谢 2011-07-08 16:49:58
看起来兄台是安装的问题吧？！最后一句：AutoGridStarter出了问题，貌似是无法启动autogrid的运算吧，而且后面也说没有WINCMD这个属性.......
前面也有TypeError，感觉像是安装问题导致程序无法运行~
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2楼2011-07-08 10:22:48
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花半开

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
Originally posted by icedreamer at 2011-07-08 10:22:48:
看起来兄台是安装的问题吧？！最后一句：AutoGridStarter出了问题，貌似是无法启动autogrid的运算吧，而且后面也说没有WINCMD这个属性.......
前面也有TypeError，感觉像是安装问题导致程序无法运行~

可是其他的加氢，去水都没问题啊！怎么才能启动autogrid呢？小女子先谢过了
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3楼2011-07-08 12:56:06
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icedreamer

新虫 (小有名气)
★ ★
ghcacj(金币+2): 谢谢 2011-07-08 16:50:35
我是按照这个帖子上面的步骤走的autogrid和autodock,一切正常，给地址你参考一下？！
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=3324861
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4楼2011-07-08 15:03:02
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icedreamer

新虫 (小有名气)
请问MM知不知道教程上面的配体ind.pdb在哪里可以下到呢？！在官网貌似可以，可是在哪里呢？！
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5楼2011-07-08 21:24:52
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花半开

新虫 (初入文坛)
★ ★
zh1987hs(金币+2): 谢谢 2011-07-09 22:38:16
内容已删除
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» 本帖已获得的红花（最新10朵）

icedreamer
6楼2011-07-08 21:32:43
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icedreamer

新虫 (小有名气)
送鲜花一朵
引用回帖:
Originally posted by 花半开 at 2011-07-08 21:32:43:
谢谢
http://autodock.scripps.edu/faqs ... -with-autodocktools 这里可以下载  是个压缩包  里面有

太感谢你啦！！！送你鲜花一朵~~原来好人是有好报的！！！
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7楼2011-07-08 22:10:22
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icedreamer

新虫 (小有名气)
你在做autodock的时候没有遇到can't create log file的问题？？？？
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8楼2011-07-13 09:36:43
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chemozhang

木虫 (正式写手)
帖子真精彩!
已经收录到淘贴专辑《分子对接问题锦集》
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故地如重游月圆更寂寞
9楼2011-09-05 19:06:29
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eynchao

新虫 (初入文坛)
这个问题我也遇到过，不过已经解决了，你下载官网上的MGL tools 1.5.6版本安装就没问题了，原来的1.5.4好像在win7下就是这么个情况同样新手，互相帮助
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10楼2012-03-29 22:24:49
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