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dadado87

新虫 (初入文坛)

[求助] 关于用morphology模块进行晶体形态模拟的问题

最近用morphology中的Growth Morphology方法对某晶胞进行晶体形态的模拟,结果与文献上的数据有很大出入,但几篇文献上的数据是一致的。使用MS4.4以及MS5.0两个版本模拟过,而且在不同的电脑上运行过,结果都是一样的。检查过晶胞参数,准确无误,对比建立起的晶胞与文献中的图片,从外观上看应该是一样的,实在不知道问题出在哪里,焦头烂额,烦请各问老师指教。
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zyj8119

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
Originally posted by dadado87 at 2011-06-27 14:55:17:
最近用morphology中的Growth Morphology方法对某晶胞进行晶体形态的模拟,结果与文献上的数据有很大出入,但几篇文献上的数据是一致的。使用MS4.4以及MS5.0两个版本模拟过,而且在不同的电脑上运行过,结果都是一 ...

无图无真相,给出具体的示意图,并且说出细节上,为什么模拟结果有偏差。。。
好好学习,天天向上。
2楼2011-06-27 15:03:05
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dadado87

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
Originally posted by zyj8119 at 2011-06-27 15:03:05:
无图无真相,给出具体的示意图,并且说出细节上,为什么模拟结果有偏差。。。

我就是不知道为什么模拟结果有偏差才来请教的……
用过Growyh Morphology方法模拟的就会知道,结果会有一个表格文件,里面会列出所有稳定的面,以及相应面的dhkl、Eatt和占晶体总表面积的百分比,我得出6个稳定的面,文献也给出6个稳定的面,其中只有5个相同,但各个面的dhkl、Eatt和占晶体总表面积的百分比则完全不同,大小顺序排列也不一致,模拟出的晶体形状自然相去甚远。
morphology模拟前我用discovery进行晶胞优化,compass力场,电荷是Forcefield assigned,Electrostatic和vdW的加和方法都是Ewald。用morphology模拟的时候其他的条件都一样,只是vdW的加和方法换成了Atom Based,因为它的下拉选项没有Ewald,只有Atom Based和Group Based,这点我也不太明白。
3楼2011-06-28 09:34:49
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