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Jfreda

铁虫 (小有名气)

[求助] 如何取平均结构

大家好,我想问一下,我用NAMD跑动力学平衡后,我想取平衡阶段的平均结构,请问该如何得到呢?谢谢!
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Jfreda

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by yahoohoo at 2011-06-27 20:03:05:
我没用过NAMD,但是思路如下:

所谓的平均结构显而易见满足这样的条件:平衡态的N个独立构象与该平均结构的RMSD应该最小,也就是说你得到的N个平衡态构象围绕平均结构波动。

我知道啊,但是我不知道该怎么得到平均结构。郁闷呐,怎么就没人知道呢
7楼2011-06-27 20:15:35
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引用回帖:
Originally posted by Jfreda at 2011-06-26 15:13:20:
大家好,我想问一下,我用NAMD跑动力学平衡后,我想取平衡阶段的平均结构,请问该如何得到呢?谢谢!

顶一下!!!
2楼2011-06-27 12:25:25
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Jfreda

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by bay__gulf at 2011-06-27 12:30:14:
没有这个概念

什么意思呢?
4楼2011-06-27 13:19:53
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Jfreda

铁虫 (小有名气)

哪位高手帮忙解答一下啊,跪求答案呐,
5楼2011-06-27 16:34:30
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