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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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Jfreda

兑换贵宾

优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！

[求助] 如何取平均结构

大家好，我想问一下，我用NAMD跑动力学平衡后，我想取平衡阶段的平均结构，请问该如何得到呢？谢谢！
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1楼 2011-06-26 15:13:20
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Jfreda

兑换贵宾

优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！
引用回帖:
Originally posted by yahoohoo at 2011-06-27 20:03:05:
我没用过NAMD，但是思路如下：

所谓的平均结构显而易见满足这样的条件：平衡态的N个独立构象与该平均结构的RMSD应该最小，也就是说你得到的N个平衡态构象围绕平均结构波动。

我知道啊，但是我不知道该怎么得到平均结构。郁闷呐，怎么就没人知道呢
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7楼2011-06-27 20:15:35
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liuyusuc

专家顾问
引用回帖:
Originally posted by Jfreda at 2011-06-26 15:13:20:
大家好，我想问一下，我用NAMD跑动力学平衡后，我想取平衡阶段的平均结构，请问该如何得到呢？谢谢！

顶一下！！！
2楼2011-06-27 12:25:25
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Jfreda

管理员

优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！
引用回帖:
Originally posted by bay__gulf at 2011-06-27 12:30:14:
没有这个概念

什么意思呢？
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4楼2011-06-27 13:19:53
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Jfreda

管理员

优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！
哪位高手帮忙解答一下啊，跪求答案呐，
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5楼2011-06-27 16:34:30
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