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Jfreda

铁虫 (小有名气)

[求助] 如何取平均结构

大家好,我想问一下,我用NAMD跑动力学平衡后,我想取平衡阶段的平均结构,请问该如何得到呢?谢谢!
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xulinan

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
ghcacj(金币+2): 谢谢 2011-07-05 13:34:29
Jfreda(金币+5): 谢谢你的回复,我已经找到答案了。 2011-07-07 10:57:31
Jfreda(金币+2): 2011-07-13 15:33:27
你说的平均构象我也没做过,说一点自己的理解,仅供参考。你提到你跑了平衡,那么我建议你计算下平衡后的RMSD的平均值,然后选择一个平衡后与该值最接近的一点,提这个时刻的pdb。
15楼2011-07-05 13:15:40
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引用回帖:
Originally posted by Jfreda at 2011-06-26 15:13:20:
大家好,我想问一下,我用NAMD跑动力学平衡后,我想取平衡阶段的平均结构,请问该如何得到呢?谢谢!

顶一下!!!
2楼2011-06-27 12:25:25
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Jfreda

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by bay__gulf at 2011-06-27 12:30:14:
没有这个概念

什么意思呢?
4楼2011-06-27 13:19:53
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Jfreda

铁虫 (小有名气)

哪位高手帮忙解答一下啊,跪求答案呐,
5楼2011-06-27 16:34:30
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